Protein–RNA interactions for Protein: Q92932

PTPRN2, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase N2, humanhuman

Predictions only

Length 1,015 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN2Q92932 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRN2Q92932 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRN2Q92932 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRN2Q92932 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRN2Q92932 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRN2Q92932 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRN2Q92932 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRN2Q92932 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRN2Q92932 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRN2Q92932 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRN2Q92932 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRN2Q92932 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRN2Q92932 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRN2Q92932 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRN2Q92932 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRN2Q92932 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRN2Q92932 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRN2Q92932 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRN2Q92932 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRN2Q92932 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRN2Q92932 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRN2Q92932 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRN2Q92932 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRN2Q92932 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRN2Q92932 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRN2Q92932 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRN2Q92932 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRN2Q92932 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRN2Q92932 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRN2Q92932 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRN2Q92932 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRN2Q92932 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRN2Q92932 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRN2Q92932 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRN2Q92932 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRN2Q92932 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRN2Q92932 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRN2Q92932 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRN2Q92932 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRN2Q92932 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRN2Q92932 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRN2Q92932 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRN2Q92932 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRN2Q92932 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRN2Q92932 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRN2Q92932 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRN2Q92932 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRN2Q92932 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRN2Q92932 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRN2Q92932 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRN2Q92932 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRN2Q92932 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRN2Q92932 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRN2Q92932 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRN2Q92932 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRN2Q92932 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRN2Q92932 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRN2Q92932 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRN2Q92932 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRN2Q92932 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRN2Q92932 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRN2Q92932 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRN2Q92932 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRN2Q92932 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRN2Q92932 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRN2Q92932 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRN2Q92932 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRN2Q92932 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRN2Q92932 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRN2Q92932 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PTPRN2Q92932 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PTPRN2Q92932 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PTPRN2Q92932 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRN2Q92932 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRN2Q92932 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRN2Q92932 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRN2Q92932 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRN2Q92932 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRN2Q92932 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRN2Q92932 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRN2Q92932 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRN2Q92932 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRN2Q92932 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRN2Q92932 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRN2Q92932 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRN2Q92932 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRN2Q92932 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRN2Q92932 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRN2Q92932 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRN2Q92932 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRN2Q92932 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRN2Q92932 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRN2Q92932 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRN2Q92932 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRN2Q92932 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRN2Q92932 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRN2Q92932 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRN2Q92932 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRN2Q92932 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRN2Q92932 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms