Protein–RNA interactions for Protein: Q92563

SPOCK2, Testican-2, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK2Q92563 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPOCK2Q92563 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPOCK2Q92563 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPOCK2Q92563 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPOCK2Q92563 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPOCK2Q92563 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPOCK2Q92563 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SPOCK2Q92563 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPOCK2Q92563 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPOCK2Q92563 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPOCK2Q92563 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SPOCK2Q92563 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SPOCK2Q92563 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPOCK2Q92563 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPOCK2Q92563 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPOCK2Q92563 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPOCK2Q92563 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPOCK2Q92563 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPOCK2Q92563 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPOCK2Q92563 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPOCK2Q92563 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPOCK2Q92563 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPOCK2Q92563 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPOCK2Q92563 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPOCK2Q92563 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SPOCK2Q92563 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPOCK2Q92563 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPOCK2Q92563 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPOCK2Q92563 DCD-201ENST00000293371 645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPOCK2Q92563 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPOCK2Q92563 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPOCK2Q92563 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPOCK2Q92563 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPOCK2Q92563 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPOCK2Q92563 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPOCK2Q92563 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPOCK2Q92563 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPOCK2Q92563 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPOCK2Q92563 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPOCK2Q92563 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPOCK2Q92563 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SPOCK2Q92563 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPOCK2Q92563 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPOCK2Q92563 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPOCK2Q92563 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SPOCK2Q92563 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPOCK2Q92563 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPOCK2Q92563 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPOCK2Q92563 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPOCK2Q92563 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPOCK2Q92563 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPOCK2Q92563 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPOCK2Q92563 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPOCK2Q92563 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPOCK2Q92563 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SPOCK2Q92563 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPOCK2Q92563 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPOCK2Q92563 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPOCK2Q92563 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPOCK2Q92563 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPOCK2Q92563 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPOCK2Q92563 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPOCK2Q92563 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SPOCK2Q92563 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPOCK2Q92563 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SPOCK2Q92563 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SPOCK2Q92563 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SPOCK2Q92563 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPOCK2Q92563 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPOCK2Q92563 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPOCK2Q92563 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPOCK2Q92563 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPOCK2Q92563 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SPOCK2Q92563 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SPOCK2Q92563 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SPOCK2Q92563 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SPOCK2Q92563 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPOCK2Q92563 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPOCK2Q92563 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SPOCK2Q92563 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPOCK2Q92563 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPOCK2Q92563 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPOCK2Q92563 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPOCK2Q92563 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPOCK2Q92563 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPOCK2Q92563 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPOCK2Q92563 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPOCK2Q92563 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPOCK2Q92563 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPOCK2Q92563 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPOCK2Q92563 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPOCK2Q92563 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SPOCK2Q92563 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPOCK2Q92563 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SPOCK2Q92563 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPOCK2Q92563 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPOCK2Q92563 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPOCK2Q92563 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPOCK2Q92563 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPOCK2Q92563 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms