Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXH2

JPH3, Junctophilin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JPH3Q8WXH2 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
JPH3Q8WXH2 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
JPH3Q8WXH2 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
JPH3Q8WXH2 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
JPH3Q8WXH2 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
JPH3Q8WXH2 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
JPH3Q8WXH2 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
JPH3Q8WXH2 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
JPH3Q8WXH2 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
JPH3Q8WXH2 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
JPH3Q8WXH2 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
JPH3Q8WXH2 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
JPH3Q8WXH2 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
JPH3Q8WXH2 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
JPH3Q8WXH2 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
JPH3Q8WXH2 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
JPH3Q8WXH2 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
JPH3Q8WXH2 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.3■■□□□ 1
JPH3Q8WXH2 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
JPH3Q8WXH2 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
JPH3Q8WXH2 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
JPH3Q8WXH2 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
JPH3Q8WXH2 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
JPH3Q8WXH2 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
JPH3Q8WXH2 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
JPH3Q8WXH2 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
JPH3Q8WXH2 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
JPH3Q8WXH2 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
JPH3Q8WXH2 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
JPH3Q8WXH2 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
JPH3Q8WXH2 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
JPH3Q8WXH2 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.29■■□□□ 1
JPH3Q8WXH2 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
JPH3Q8WXH2 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
JPH3Q8WXH2 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
JPH3Q8WXH2 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
JPH3Q8WXH2 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
JPH3Q8WXH2 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
JPH3Q8WXH2 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
JPH3Q8WXH2 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
JPH3Q8WXH2 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
JPH3Q8WXH2 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
JPH3Q8WXH2 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
JPH3Q8WXH2 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
JPH3Q8WXH2 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
JPH3Q8WXH2 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
JPH3Q8WXH2 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
JPH3Q8WXH2 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
JPH3Q8WXH2 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
JPH3Q8WXH2 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
JPH3Q8WXH2 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
JPH3Q8WXH2 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
JPH3Q8WXH2 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
JPH3Q8WXH2 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.28■■□□□ 1
JPH3Q8WXH2 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
JPH3Q8WXH2 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.28■■□□□ 1
JPH3Q8WXH2 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
JPH3Q8WXH2 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
JPH3Q8WXH2 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
JPH3Q8WXH2 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
JPH3Q8WXH2 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
JPH3Q8WXH2 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
JPH3Q8WXH2 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
JPH3Q8WXH2 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
JPH3Q8WXH2 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
JPH3Q8WXH2 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
JPH3Q8WXH2 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
JPH3Q8WXH2 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
JPH3Q8WXH2 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
JPH3Q8WXH2 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
JPH3Q8WXH2 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
JPH3Q8WXH2 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
JPH3Q8WXH2 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.27■■□□□ 1
JPH3Q8WXH2 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
JPH3Q8WXH2 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
JPH3Q8WXH2 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
JPH3Q8WXH2 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
JPH3Q8WXH2 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
JPH3Q8WXH2 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
JPH3Q8WXH2 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
JPH3Q8WXH2 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
JPH3Q8WXH2 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
JPH3Q8WXH2 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
JPH3Q8WXH2 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
JPH3Q8WXH2 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
JPH3Q8WXH2 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
JPH3Q8WXH2 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
JPH3Q8WXH2 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
JPH3Q8WXH2 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
JPH3Q8WXH2 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
JPH3Q8WXH2 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
JPH3Q8WXH2 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
JPH3Q8WXH2 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
JPH3Q8WXH2 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
JPH3Q8WXH2 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
JPH3Q8WXH2 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
JPH3Q8WXH2 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
JPH3Q8WXH2 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
JPH3Q8WXH2 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
JPH3Q8WXH2 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms