Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV22

NSMCE1, Non-structural maintenance of chromosomes element 1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE1Q8WV22 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NSMCE1Q8WV22 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NSMCE1Q8WV22 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NSMCE1Q8WV22 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NSMCE1Q8WV22 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NSMCE1Q8WV22 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NSMCE1Q8WV22 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NSMCE1Q8WV22 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NSMCE1Q8WV22 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NSMCE1Q8WV22 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NSMCE1Q8WV22 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NSMCE1Q8WV22 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NSMCE1Q8WV22 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NSMCE1Q8WV22 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NSMCE1Q8WV22 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NSMCE1Q8WV22 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NSMCE1Q8WV22 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NSMCE1Q8WV22 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NSMCE1Q8WV22 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NSMCE1Q8WV22 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NSMCE1Q8WV22 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NSMCE1Q8WV22 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NSMCE1Q8WV22 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NSMCE1Q8WV22 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NSMCE1Q8WV22 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NSMCE1Q8WV22 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NSMCE1Q8WV22 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NSMCE1Q8WV22 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NSMCE1Q8WV22 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NSMCE1Q8WV22 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NSMCE1Q8WV22 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NSMCE1Q8WV22 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NSMCE1Q8WV22 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NSMCE1Q8WV22 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NSMCE1Q8WV22 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NSMCE1Q8WV22 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NSMCE1Q8WV22 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NSMCE1Q8WV22 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NSMCE1Q8WV22 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NSMCE1Q8WV22 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NSMCE1Q8WV22 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NSMCE1Q8WV22 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NSMCE1Q8WV22 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NSMCE1Q8WV22 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NSMCE1Q8WV22 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NSMCE1Q8WV22 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NSMCE1Q8WV22 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NSMCE1Q8WV22 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NSMCE1Q8WV22 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NSMCE1Q8WV22 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NSMCE1Q8WV22 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NSMCE1Q8WV22 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NSMCE1Q8WV22 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NSMCE1Q8WV22 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NSMCE1Q8WV22 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NSMCE1Q8WV22 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NSMCE1Q8WV22 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NSMCE1Q8WV22 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
NSMCE1Q8WV22 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NSMCE1Q8WV22 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NSMCE1Q8WV22 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NSMCE1Q8WV22 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NSMCE1Q8WV22 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NSMCE1Q8WV22 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NSMCE1Q8WV22 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NSMCE1Q8WV22 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NSMCE1Q8WV22 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NSMCE1Q8WV22 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NSMCE1Q8WV22 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NSMCE1Q8WV22 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NSMCE1Q8WV22 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NSMCE1Q8WV22 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NSMCE1Q8WV22 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NSMCE1Q8WV22 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NSMCE1Q8WV22 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NSMCE1Q8WV22 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NSMCE1Q8WV22 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NSMCE1Q8WV22 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NSMCE1Q8WV22 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NSMCE1Q8WV22 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NSMCE1Q8WV22 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NSMCE1Q8WV22 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NSMCE1Q8WV22 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NSMCE1Q8WV22 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NSMCE1Q8WV22 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NSMCE1Q8WV22 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NSMCE1Q8WV22 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NSMCE1Q8WV22 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NSMCE1Q8WV22 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NSMCE1Q8WV22 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NSMCE1Q8WV22 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NSMCE1Q8WV22 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NSMCE1Q8WV22 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NSMCE1Q8WV22 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NSMCE1Q8WV22 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NSMCE1Q8WV22 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NSMCE1Q8WV22 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NSMCE1Q8WV22 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
NSMCE1Q8WV22 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NSMCE1Q8WV22 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms