Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEE9

SAP25, Histone deacetylase complex subunit SAP25, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAP25Q8TEE9 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SAP25Q8TEE9 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SAP25Q8TEE9 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SAP25Q8TEE9 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SAP25Q8TEE9 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SAP25Q8TEE9 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SAP25Q8TEE9 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SAP25Q8TEE9 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SAP25Q8TEE9 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SAP25Q8TEE9 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SAP25Q8TEE9 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SAP25Q8TEE9 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SAP25Q8TEE9 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SAP25Q8TEE9 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SAP25Q8TEE9 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SAP25Q8TEE9 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
SAP25Q8TEE9 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SAP25Q8TEE9 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SAP25Q8TEE9 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SAP25Q8TEE9 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SAP25Q8TEE9 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SAP25Q8TEE9 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SAP25Q8TEE9 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SAP25Q8TEE9 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SAP25Q8TEE9 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SAP25Q8TEE9 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SAP25Q8TEE9 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SAP25Q8TEE9 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SAP25Q8TEE9 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SAP25Q8TEE9 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SAP25Q8TEE9 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SAP25Q8TEE9 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SAP25Q8TEE9 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SAP25Q8TEE9 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SAP25Q8TEE9 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SAP25Q8TEE9 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SAP25Q8TEE9 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SAP25Q8TEE9 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SAP25Q8TEE9 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SAP25Q8TEE9 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SAP25Q8TEE9 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SAP25Q8TEE9 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SAP25Q8TEE9 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SAP25Q8TEE9 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SAP25Q8TEE9 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SAP25Q8TEE9 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SAP25Q8TEE9 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SAP25Q8TEE9 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SAP25Q8TEE9 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SAP25Q8TEE9 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SAP25Q8TEE9 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SAP25Q8TEE9 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SAP25Q8TEE9 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SAP25Q8TEE9 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SAP25Q8TEE9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SAP25Q8TEE9 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SAP25Q8TEE9 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SAP25Q8TEE9 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SAP25Q8TEE9 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SAP25Q8TEE9 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SAP25Q8TEE9 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SAP25Q8TEE9 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SAP25Q8TEE9 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SAP25Q8TEE9 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SAP25Q8TEE9 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SAP25Q8TEE9 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SAP25Q8TEE9 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SAP25Q8TEE9 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SAP25Q8TEE9 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SAP25Q8TEE9 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SAP25Q8TEE9 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SAP25Q8TEE9 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SAP25Q8TEE9 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SAP25Q8TEE9 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SAP25Q8TEE9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SAP25Q8TEE9 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SAP25Q8TEE9 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SAP25Q8TEE9 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SAP25Q8TEE9 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SAP25Q8TEE9 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SAP25Q8TEE9 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SAP25Q8TEE9 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SAP25Q8TEE9 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SAP25Q8TEE9 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SAP25Q8TEE9 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SAP25Q8TEE9 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SAP25Q8TEE9 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SAP25Q8TEE9 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SAP25Q8TEE9 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SAP25Q8TEE9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SAP25Q8TEE9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SAP25Q8TEE9 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SAP25Q8TEE9 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SAP25Q8TEE9 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SAP25Q8TEE9 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SAP25Q8TEE9 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SAP25Q8TEE9 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SAP25Q8TEE9 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SAP25Q8TEE9 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SAP25Q8TEE9 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.8 ms