Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCY6

MSANTD4, Myb/SANT-like DNA-binding domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSANTD4Q8NCY6 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MSANTD4Q8NCY6 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MSANTD4Q8NCY6 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MSANTD4Q8NCY6 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MSANTD4Q8NCY6 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MSANTD4Q8NCY6 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MSANTD4Q8NCY6 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MSANTD4Q8NCY6 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MSANTD4Q8NCY6 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MSANTD4Q8NCY6 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MSANTD4Q8NCY6 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MSANTD4Q8NCY6 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MSANTD4Q8NCY6 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MSANTD4Q8NCY6 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MSANTD4Q8NCY6 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MSANTD4Q8NCY6 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
MSANTD4Q8NCY6 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
MSANTD4Q8NCY6 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
MSANTD4Q8NCY6 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
MSANTD4Q8NCY6 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
MSANTD4Q8NCY6 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.36
MSANTD4Q8NCY6 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
MSANTD4Q8NCY6 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MSANTD4Q8NCY6 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MSANTD4Q8NCY6 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MSANTD4Q8NCY6 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MSANTD4Q8NCY6 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
MSANTD4Q8NCY6 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MSANTD4Q8NCY6 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MSANTD4Q8NCY6 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MSANTD4Q8NCY6 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MSANTD4Q8NCY6 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MSANTD4Q8NCY6 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MSANTD4Q8NCY6 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MSANTD4Q8NCY6 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MSANTD4Q8NCY6 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MSANTD4Q8NCY6 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MSANTD4Q8NCY6 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MSANTD4Q8NCY6 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MSANTD4Q8NCY6 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MSANTD4Q8NCY6 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MSANTD4Q8NCY6 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MSANTD4Q8NCY6 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MSANTD4Q8NCY6 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MSANTD4Q8NCY6 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MSANTD4Q8NCY6 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MSANTD4Q8NCY6 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MSANTD4Q8NCY6 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MSANTD4Q8NCY6 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MSANTD4Q8NCY6 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MSANTD4Q8NCY6 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MSANTD4Q8NCY6 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MSANTD4Q8NCY6 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MSANTD4Q8NCY6 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
MSANTD4Q8NCY6 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MSANTD4Q8NCY6 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MSANTD4Q8NCY6 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MSANTD4Q8NCY6 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MSANTD4Q8NCY6 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MSANTD4Q8NCY6 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MSANTD4Q8NCY6 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MSANTD4Q8NCY6 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MSANTD4Q8NCY6 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MSANTD4Q8NCY6 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MSANTD4Q8NCY6 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MSANTD4Q8NCY6 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
MSANTD4Q8NCY6 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MSANTD4Q8NCY6 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
MSANTD4Q8NCY6 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MSANTD4Q8NCY6 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MSANTD4Q8NCY6 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MSANTD4Q8NCY6 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MSANTD4Q8NCY6 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MSANTD4Q8NCY6 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MSANTD4Q8NCY6 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MSANTD4Q8NCY6 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MSANTD4Q8NCY6 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MSANTD4Q8NCY6 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MSANTD4Q8NCY6 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MSANTD4Q8NCY6 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MSANTD4Q8NCY6 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MSANTD4Q8NCY6 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MSANTD4Q8NCY6 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MSANTD4Q8NCY6 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MSANTD4Q8NCY6 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MSANTD4Q8NCY6 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MSANTD4Q8NCY6 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MSANTD4Q8NCY6 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MSANTD4Q8NCY6 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MSANTD4Q8NCY6 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
MSANTD4Q8NCY6 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
MSANTD4Q8NCY6 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
MSANTD4Q8NCY6 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MSANTD4Q8NCY6 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MSANTD4Q8NCY6 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MSANTD4Q8NCY6 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MSANTD4Q8NCY6 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MSANTD4Q8NCY6 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MSANTD4Q8NCY6 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MSANTD4Q8NCY6 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms