Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCN5

PDPR, Pyruvate dehydrogenase phosphatase regulatory subunit, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 879 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDPRQ8NCN5 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDPRQ8NCN5 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDPRQ8NCN5 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDPRQ8NCN5 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PDPRQ8NCN5 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDPRQ8NCN5 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDPRQ8NCN5 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDPRQ8NCN5 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDPRQ8NCN5 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDPRQ8NCN5 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDPRQ8NCN5 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDPRQ8NCN5 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDPRQ8NCN5 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDPRQ8NCN5 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDPRQ8NCN5 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDPRQ8NCN5 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDPRQ8NCN5 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDPRQ8NCN5 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDPRQ8NCN5 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDPRQ8NCN5 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDPRQ8NCN5 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDPRQ8NCN5 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDPRQ8NCN5 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDPRQ8NCN5 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDPRQ8NCN5 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDPRQ8NCN5 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDPRQ8NCN5 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDPRQ8NCN5 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDPRQ8NCN5 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDPRQ8NCN5 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDPRQ8NCN5 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDPRQ8NCN5 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDPRQ8NCN5 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PDPRQ8NCN5 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDPRQ8NCN5 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PDPRQ8NCN5 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PDPRQ8NCN5 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
PDPRQ8NCN5 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PDPRQ8NCN5 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDPRQ8NCN5 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PDPRQ8NCN5 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PDPRQ8NCN5 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDPRQ8NCN5 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDPRQ8NCN5 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDPRQ8NCN5 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PDPRQ8NCN5 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PDPRQ8NCN5 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PDPRQ8NCN5 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PDPRQ8NCN5 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDPRQ8NCN5 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PDPRQ8NCN5 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDPRQ8NCN5 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PDPRQ8NCN5 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDPRQ8NCN5 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDPRQ8NCN5 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDPRQ8NCN5 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDPRQ8NCN5 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDPRQ8NCN5 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDPRQ8NCN5 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDPRQ8NCN5 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDPRQ8NCN5 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDPRQ8NCN5 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PDPRQ8NCN5 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDPRQ8NCN5 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDPRQ8NCN5 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PDPRQ8NCN5 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDPRQ8NCN5 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDPRQ8NCN5 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDPRQ8NCN5 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDPRQ8NCN5 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PDPRQ8NCN5 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PDPRQ8NCN5 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDPRQ8NCN5 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PDPRQ8NCN5 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDPRQ8NCN5 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PDPRQ8NCN5 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PDPRQ8NCN5 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDPRQ8NCN5 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDPRQ8NCN5 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDPRQ8NCN5 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PDPRQ8NCN5 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PDPRQ8NCN5 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDPRQ8NCN5 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PDPRQ8NCN5 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PDPRQ8NCN5 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PDPRQ8NCN5 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PDPRQ8NCN5 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PDPRQ8NCN5 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDPRQ8NCN5 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PDPRQ8NCN5 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDPRQ8NCN5 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PDPRQ8NCN5 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PDPRQ8NCN5 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDPRQ8NCN5 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PDPRQ8NCN5 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PDPRQ8NCN5 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDPRQ8NCN5 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PDPRQ8NCN5 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PDPRQ8NCN5 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDPRQ8NCN5 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.6 ms