Protein–RNA interactions for Protein: Q8N158

GPC2, Glypican-2, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC2Q8N158 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GPC2Q8N158 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
GPC2Q8N158 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GPC2Q8N158 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GPC2Q8N158 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GPC2Q8N158 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GPC2Q8N158 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GPC2Q8N158 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
GPC2Q8N158 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GPC2Q8N158 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GPC2Q8N158 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GPC2Q8N158 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GPC2Q8N158 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GPC2Q8N158 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GPC2Q8N158 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GPC2Q8N158 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GPC2Q8N158 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GPC2Q8N158 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GPC2Q8N158 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GPC2Q8N158 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
GPC2Q8N158 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GPC2Q8N158 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GPC2Q8N158 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GPC2Q8N158 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GPC2Q8N158 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
GPC2Q8N158 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GPC2Q8N158 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GPC2Q8N158 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GPC2Q8N158 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GPC2Q8N158 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GPC2Q8N158 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GPC2Q8N158 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GPC2Q8N158 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GPC2Q8N158 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GPC2Q8N158 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GPC2Q8N158 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GPC2Q8N158 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GPC2Q8N158 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GPC2Q8N158 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GPC2Q8N158 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GPC2Q8N158 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GPC2Q8N158 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GPC2Q8N158 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GPC2Q8N158 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
GPC2Q8N158 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GPC2Q8N158 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GPC2Q8N158 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GPC2Q8N158 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GPC2Q8N158 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
GPC2Q8N158 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
GPC2Q8N158 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
GPC2Q8N158 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GPC2Q8N158 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GPC2Q8N158 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GPC2Q8N158 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GPC2Q8N158 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GPC2Q8N158 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GPC2Q8N158 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GPC2Q8N158 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GPC2Q8N158 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GPC2Q8N158 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GPC2Q8N158 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
GPC2Q8N158 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GPC2Q8N158 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GPC2Q8N158 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GPC2Q8N158 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GPC2Q8N158 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GPC2Q8N158 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GPC2Q8N158 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GPC2Q8N158 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GPC2Q8N158 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GPC2Q8N158 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GPC2Q8N158 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GPC2Q8N158 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
GPC2Q8N158 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GPC2Q8N158 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GPC2Q8N158 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GPC2Q8N158 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GPC2Q8N158 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GPC2Q8N158 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GPC2Q8N158 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GPC2Q8N158 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GPC2Q8N158 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GPC2Q8N158 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GPC2Q8N158 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GPC2Q8N158 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GPC2Q8N158 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GPC2Q8N158 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GPC2Q8N158 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GPC2Q8N158 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GPC2Q8N158 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GPC2Q8N158 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GPC2Q8N158 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GPC2Q8N158 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
GPC2Q8N158 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GPC2Q8N158 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GPC2Q8N158 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
GPC2Q8N158 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GPC2Q8N158 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GPC2Q8N158 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms