Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYT3

CCDC170, Coiled-coil domain-containing protein 170, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC170Q8IYT3 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC170Q8IYT3 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC170Q8IYT3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC170Q8IYT3 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC170Q8IYT3 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC170Q8IYT3 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC170Q8IYT3 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC170Q8IYT3 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC170Q8IYT3 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC170Q8IYT3 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC170Q8IYT3 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC170Q8IYT3 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC170Q8IYT3 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC170Q8IYT3 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC170Q8IYT3 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC170Q8IYT3 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC170Q8IYT3 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC170Q8IYT3 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC170Q8IYT3 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC170Q8IYT3 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC170Q8IYT3 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC170Q8IYT3 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC170Q8IYT3 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC170Q8IYT3 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC170Q8IYT3 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC170Q8IYT3 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC170Q8IYT3 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC170Q8IYT3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC170Q8IYT3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC170Q8IYT3 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC170Q8IYT3 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC170Q8IYT3 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC170Q8IYT3 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC170Q8IYT3 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC170Q8IYT3 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC170Q8IYT3 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC170Q8IYT3 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC170Q8IYT3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC170Q8IYT3 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC170Q8IYT3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC170Q8IYT3 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC170Q8IYT3 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC170Q8IYT3 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC170Q8IYT3 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC170Q8IYT3 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC170Q8IYT3 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC170Q8IYT3 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC170Q8IYT3 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC170Q8IYT3 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC170Q8IYT3 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC170Q8IYT3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC170Q8IYT3 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC170Q8IYT3 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC170Q8IYT3 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC170Q8IYT3 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC170Q8IYT3 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC170Q8IYT3 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC170Q8IYT3 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC170Q8IYT3 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC170Q8IYT3 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC170Q8IYT3 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC170Q8IYT3 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC170Q8IYT3 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC170Q8IYT3 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC170Q8IYT3 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC170Q8IYT3 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC170Q8IYT3 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC170Q8IYT3 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC170Q8IYT3 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC170Q8IYT3 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC170Q8IYT3 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC170Q8IYT3 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC170Q8IYT3 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC170Q8IYT3 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC170Q8IYT3 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC170Q8IYT3 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC170Q8IYT3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC170Q8IYT3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC170Q8IYT3 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC170Q8IYT3 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC170Q8IYT3 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC170Q8IYT3 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC170Q8IYT3 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC170Q8IYT3 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC170Q8IYT3 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC170Q8IYT3 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC170Q8IYT3 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC170Q8IYT3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC170Q8IYT3 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC170Q8IYT3 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC170Q8IYT3 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC170Q8IYT3 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC170Q8IYT3 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC170Q8IYT3 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC170Q8IYT3 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC170Q8IYT3 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC170Q8IYT3 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC170Q8IYT3 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC170Q8IYT3 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC170Q8IYT3 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms