Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWD4

CCDC117, Coiled-coil domain-containing protein 117, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC117Q8IWD4 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC117Q8IWD4 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC117Q8IWD4 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC117Q8IWD4 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC117Q8IWD4 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC117Q8IWD4 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC117Q8IWD4 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC117Q8IWD4 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC117Q8IWD4 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC117Q8IWD4 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC117Q8IWD4 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC117Q8IWD4 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC117Q8IWD4 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC117Q8IWD4 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC117Q8IWD4 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC117Q8IWD4 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC117Q8IWD4 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC117Q8IWD4 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC117Q8IWD4 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC117Q8IWD4 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC117Q8IWD4 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC117Q8IWD4 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC117Q8IWD4 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC117Q8IWD4 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC117Q8IWD4 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC117Q8IWD4 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC117Q8IWD4 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC117Q8IWD4 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC117Q8IWD4 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC117Q8IWD4 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC117Q8IWD4 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC117Q8IWD4 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC117Q8IWD4 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC117Q8IWD4 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC117Q8IWD4 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC117Q8IWD4 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC117Q8IWD4 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC117Q8IWD4 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC117Q8IWD4 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC117Q8IWD4 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC117Q8IWD4 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC117Q8IWD4 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC117Q8IWD4 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC117Q8IWD4 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC117Q8IWD4 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC117Q8IWD4 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC117Q8IWD4 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC117Q8IWD4 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC117Q8IWD4 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC117Q8IWD4 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC117Q8IWD4 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC117Q8IWD4 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC117Q8IWD4 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC117Q8IWD4 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC117Q8IWD4 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC117Q8IWD4 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC117Q8IWD4 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC117Q8IWD4 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC117Q8IWD4 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC117Q8IWD4 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC117Q8IWD4 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC117Q8IWD4 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC117Q8IWD4 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC117Q8IWD4 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC117Q8IWD4 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC117Q8IWD4 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC117Q8IWD4 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC117Q8IWD4 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC117Q8IWD4 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC117Q8IWD4 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC117Q8IWD4 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC117Q8IWD4 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC117Q8IWD4 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC117Q8IWD4 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC117Q8IWD4 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC117Q8IWD4 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC117Q8IWD4 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC117Q8IWD4 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC117Q8IWD4 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC117Q8IWD4 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC117Q8IWD4 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC117Q8IWD4 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC117Q8IWD4 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC117Q8IWD4 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC117Q8IWD4 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC117Q8IWD4 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC117Q8IWD4 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC117Q8IWD4 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC117Q8IWD4 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC117Q8IWD4 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC117Q8IWD4 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC117Q8IWD4 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC117Q8IWD4 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC117Q8IWD4 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC117Q8IWD4 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC117Q8IWD4 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC117Q8IWD4 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC117Q8IWD4 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC117Q8IWD4 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC117Q8IWD4 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms