Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVB4

SLC9A9, Sodium/hydrogen exchanger 9, humanhuman

Predictions only

Length 645 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A9Q8IVB4 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC9A9Q8IVB4 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC9A9Q8IVB4 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC9A9Q8IVB4 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC9A9Q8IVB4 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC9A9Q8IVB4 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC9A9Q8IVB4 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC9A9Q8IVB4 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC9A9Q8IVB4 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC9A9Q8IVB4 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC9A9Q8IVB4 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC9A9Q8IVB4 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC9A9Q8IVB4 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC9A9Q8IVB4 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC9A9Q8IVB4 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC9A9Q8IVB4 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC9A9Q8IVB4 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC9A9Q8IVB4 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC9A9Q8IVB4 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC9A9Q8IVB4 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC9A9Q8IVB4 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC9A9Q8IVB4 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC9A9Q8IVB4 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC9A9Q8IVB4 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC9A9Q8IVB4 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC9A9Q8IVB4 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC9A9Q8IVB4 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC9A9Q8IVB4 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC9A9Q8IVB4 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC9A9Q8IVB4 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC9A9Q8IVB4 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC9A9Q8IVB4 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC9A9Q8IVB4 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC9A9Q8IVB4 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC9A9Q8IVB4 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC9A9Q8IVB4 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC9A9Q8IVB4 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC9A9Q8IVB4 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC9A9Q8IVB4 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC9A9Q8IVB4 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC9A9Q8IVB4 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC9A9Q8IVB4 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC9A9Q8IVB4 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC9A9Q8IVB4 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC9A9Q8IVB4 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC9A9Q8IVB4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC9A9Q8IVB4 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC9A9Q8IVB4 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC9A9Q8IVB4 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC9A9Q8IVB4 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC9A9Q8IVB4 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC9A9Q8IVB4 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC9A9Q8IVB4 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC9A9Q8IVB4 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC9A9Q8IVB4 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC9A9Q8IVB4 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC9A9Q8IVB4 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC9A9Q8IVB4 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC9A9Q8IVB4 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC9A9Q8IVB4 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC9A9Q8IVB4 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC9A9Q8IVB4 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC9A9Q8IVB4 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC9A9Q8IVB4 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC9A9Q8IVB4 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC9A9Q8IVB4 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC9A9Q8IVB4 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC9A9Q8IVB4 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC9A9Q8IVB4 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC9A9Q8IVB4 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC9A9Q8IVB4 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC9A9Q8IVB4 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC9A9Q8IVB4 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC9A9Q8IVB4 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC9A9Q8IVB4 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC9A9Q8IVB4 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC9A9Q8IVB4 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC9A9Q8IVB4 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC9A9Q8IVB4 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC9A9Q8IVB4 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC9A9Q8IVB4 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC9A9Q8IVB4 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC9A9Q8IVB4 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC9A9Q8IVB4 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC9A9Q8IVB4 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC9A9Q8IVB4 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC9A9Q8IVB4 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC9A9Q8IVB4 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC9A9Q8IVB4 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC9A9Q8IVB4 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC9A9Q8IVB4 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC9A9Q8IVB4 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC9A9Q8IVB4 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC9A9Q8IVB4 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC9A9Q8IVB4 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC9A9Q8IVB4 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC9A9Q8IVB4 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC9A9Q8IVB4 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC9A9Q8IVB4 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC9A9Q8IVB4 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms