Protein–RNA interactions for Protein: Q86WP2

GPBP1, Vasculin, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPBP1Q86WP2 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GPBP1Q86WP2 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GPBP1Q86WP2 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GPBP1Q86WP2 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GPBP1Q86WP2 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GPBP1Q86WP2 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GPBP1Q86WP2 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GPBP1Q86WP2 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GPBP1Q86WP2 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GPBP1Q86WP2 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GPBP1Q86WP2 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GPBP1Q86WP2 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GPBP1Q86WP2 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GPBP1Q86WP2 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
GPBP1Q86WP2 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GPBP1Q86WP2 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GPBP1Q86WP2 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GPBP1Q86WP2 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GPBP1Q86WP2 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GPBP1Q86WP2 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GPBP1Q86WP2 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GPBP1Q86WP2 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GPBP1Q86WP2 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GPBP1Q86WP2 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GPBP1Q86WP2 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GPBP1Q86WP2 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GPBP1Q86WP2 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
GPBP1Q86WP2 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GPBP1Q86WP2 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GPBP1Q86WP2 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GPBP1Q86WP2 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
GPBP1Q86WP2 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
GPBP1Q86WP2 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GPBP1Q86WP2 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GPBP1Q86WP2 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GPBP1Q86WP2 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GPBP1Q86WP2 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GPBP1Q86WP2 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
GPBP1Q86WP2 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GPBP1Q86WP2 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GPBP1Q86WP2 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GPBP1Q86WP2 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
GPBP1Q86WP2 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GPBP1Q86WP2 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GPBP1Q86WP2 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GPBP1Q86WP2 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GPBP1Q86WP2 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GPBP1Q86WP2 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GPBP1Q86WP2 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GPBP1Q86WP2 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
GPBP1Q86WP2 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GPBP1Q86WP2 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GPBP1Q86WP2 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GPBP1Q86WP2 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
GPBP1Q86WP2 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GPBP1Q86WP2 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GPBP1Q86WP2 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GPBP1Q86WP2 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GPBP1Q86WP2 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GPBP1Q86WP2 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GPBP1Q86WP2 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GPBP1Q86WP2 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GPBP1Q86WP2 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GPBP1Q86WP2 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GPBP1Q86WP2 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GPBP1Q86WP2 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GPBP1Q86WP2 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GPBP1Q86WP2 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GPBP1Q86WP2 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GPBP1Q86WP2 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GPBP1Q86WP2 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GPBP1Q86WP2 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GPBP1Q86WP2 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
GPBP1Q86WP2 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GPBP1Q86WP2 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GPBP1Q86WP2 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GPBP1Q86WP2 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GPBP1Q86WP2 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GPBP1Q86WP2 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GPBP1Q86WP2 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GPBP1Q86WP2 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
GPBP1Q86WP2 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GPBP1Q86WP2 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GPBP1Q86WP2 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GPBP1Q86WP2 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
GPBP1Q86WP2 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
GPBP1Q86WP2 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GPBP1Q86WP2 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GPBP1Q86WP2 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GPBP1Q86WP2 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
GPBP1Q86WP2 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GPBP1Q86WP2 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GPBP1Q86WP2 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GPBP1Q86WP2 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GPBP1Q86WP2 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GPBP1Q86WP2 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GPBP1Q86WP2 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GPBP1Q86WP2 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GPBP1Q86WP2 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GPBP1Q86WP2 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms