Protein–RNA interactions for Protein: Q86UA1

PRPF39, Pre-mRNA-processing factor 39, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF39Q86UA1 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRPF39Q86UA1 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRPF39Q86UA1 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRPF39Q86UA1 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PRPF39Q86UA1 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRPF39Q86UA1 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRPF39Q86UA1 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRPF39Q86UA1 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRPF39Q86UA1 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRPF39Q86UA1 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRPF39Q86UA1 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRPF39Q86UA1 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRPF39Q86UA1 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRPF39Q86UA1 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRPF39Q86UA1 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PRPF39Q86UA1 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRPF39Q86UA1 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRPF39Q86UA1 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRPF39Q86UA1 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRPF39Q86UA1 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRPF39Q86UA1 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRPF39Q86UA1 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PRPF39Q86UA1 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRPF39Q86UA1 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRPF39Q86UA1 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRPF39Q86UA1 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PRPF39Q86UA1 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRPF39Q86UA1 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRPF39Q86UA1 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRPF39Q86UA1 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRPF39Q86UA1 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRPF39Q86UA1 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRPF39Q86UA1 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRPF39Q86UA1 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRPF39Q86UA1 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRPF39Q86UA1 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRPF39Q86UA1 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRPF39Q86UA1 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRPF39Q86UA1 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRPF39Q86UA1 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PRPF39Q86UA1 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PRPF39Q86UA1 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRPF39Q86UA1 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRPF39Q86UA1 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRPF39Q86UA1 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRPF39Q86UA1 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRPF39Q86UA1 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRPF39Q86UA1 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRPF39Q86UA1 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PRPF39Q86UA1 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRPF39Q86UA1 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRPF39Q86UA1 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PRPF39Q86UA1 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRPF39Q86UA1 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRPF39Q86UA1 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRPF39Q86UA1 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRPF39Q86UA1 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRPF39Q86UA1 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRPF39Q86UA1 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRPF39Q86UA1 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
PRPF39Q86UA1 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
PRPF39Q86UA1 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRPF39Q86UA1 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PRPF39Q86UA1 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRPF39Q86UA1 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRPF39Q86UA1 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRPF39Q86UA1 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRPF39Q86UA1 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRPF39Q86UA1 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRPF39Q86UA1 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRPF39Q86UA1 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRPF39Q86UA1 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRPF39Q86UA1 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRPF39Q86UA1 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRPF39Q86UA1 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRPF39Q86UA1 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRPF39Q86UA1 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRPF39Q86UA1 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRPF39Q86UA1 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRPF39Q86UA1 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRPF39Q86UA1 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRPF39Q86UA1 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRPF39Q86UA1 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRPF39Q86UA1 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRPF39Q86UA1 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PRPF39Q86UA1 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRPF39Q86UA1 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRPF39Q86UA1 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRPF39Q86UA1 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRPF39Q86UA1 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRPF39Q86UA1 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRPF39Q86UA1 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRPF39Q86UA1 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRPF39Q86UA1 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRPF39Q86UA1 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRPF39Q86UA1 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRPF39Q86UA1 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRPF39Q86UA1 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRPF39Q86UA1 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRPF39Q86UA1 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms