Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5M5

TMC3, Transmembrane channel-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC3Q7Z5M5 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMC3Q7Z5M5 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMC3Q7Z5M5 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMC3Q7Z5M5 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMC3Q7Z5M5 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMC3Q7Z5M5 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMC3Q7Z5M5 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMC3Q7Z5M5 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMC3Q7Z5M5 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMC3Q7Z5M5 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMC3Q7Z5M5 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TMC3Q7Z5M5 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMC3Q7Z5M5 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMC3Q7Z5M5 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMC3Q7Z5M5 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMC3Q7Z5M5 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TMC3Q7Z5M5 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMC3Q7Z5M5 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMC3Q7Z5M5 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMC3Q7Z5M5 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMC3Q7Z5M5 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMC3Q7Z5M5 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMC3Q7Z5M5 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMC3Q7Z5M5 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMC3Q7Z5M5 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TMC3Q7Z5M5 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMC3Q7Z5M5 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMC3Q7Z5M5 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMC3Q7Z5M5 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMC3Q7Z5M5 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMC3Q7Z5M5 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMC3Q7Z5M5 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMC3Q7Z5M5 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMC3Q7Z5M5 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMC3Q7Z5M5 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMC3Q7Z5M5 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TMC3Q7Z5M5 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMC3Q7Z5M5 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMC3Q7Z5M5 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMC3Q7Z5M5 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMC3Q7Z5M5 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TMC3Q7Z5M5 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMC3Q7Z5M5 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMC3Q7Z5M5 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMC3Q7Z5M5 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMC3Q7Z5M5 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMC3Q7Z5M5 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMC3Q7Z5M5 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMC3Q7Z5M5 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMC3Q7Z5M5 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMC3Q7Z5M5 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMC3Q7Z5M5 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMC3Q7Z5M5 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMC3Q7Z5M5 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMC3Q7Z5M5 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMC3Q7Z5M5 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMC3Q7Z5M5 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMC3Q7Z5M5 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMC3Q7Z5M5 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMC3Q7Z5M5 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMC3Q7Z5M5 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMC3Q7Z5M5 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMC3Q7Z5M5 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMC3Q7Z5M5 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMC3Q7Z5M5 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMC3Q7Z5M5 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMC3Q7Z5M5 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMC3Q7Z5M5 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMC3Q7Z5M5 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMC3Q7Z5M5 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMC3Q7Z5M5 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMC3Q7Z5M5 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMC3Q7Z5M5 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMC3Q7Z5M5 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMC3Q7Z5M5 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMC3Q7Z5M5 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMC3Q7Z5M5 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMC3Q7Z5M5 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMC3Q7Z5M5 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMC3Q7Z5M5 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMC3Q7Z5M5 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMC3Q7Z5M5 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMC3Q7Z5M5 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMC3Q7Z5M5 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMC3Q7Z5M5 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMC3Q7Z5M5 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMC3Q7Z5M5 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMC3Q7Z5M5 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMC3Q7Z5M5 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMC3Q7Z5M5 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMC3Q7Z5M5 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMC3Q7Z5M5 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMC3Q7Z5M5 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMC3Q7Z5M5 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMC3Q7Z5M5 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMC3Q7Z5M5 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMC3Q7Z5M5 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TMC3Q7Z5M5 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMC3Q7Z5M5 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMC3Q7Z5M5 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 185.8 ms