Protein–RNA interactions for Protein: Q7L5L3

GDPD3, Lysophospholipase D GDPD3, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDPD3Q7L5L3 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
GDPD3Q7L5L3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GDPD3Q7L5L3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GDPD3Q7L5L3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GDPD3Q7L5L3 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GDPD3Q7L5L3 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GDPD3Q7L5L3 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GDPD3Q7L5L3 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GDPD3Q7L5L3 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GDPD3Q7L5L3 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GDPD3Q7L5L3 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
GDPD3Q7L5L3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GDPD3Q7L5L3 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
GDPD3Q7L5L3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GDPD3Q7L5L3 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GDPD3Q7L5L3 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GDPD3Q7L5L3 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GDPD3Q7L5L3 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GDPD3Q7L5L3 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GDPD3Q7L5L3 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GDPD3Q7L5L3 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GDPD3Q7L5L3 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GDPD3Q7L5L3 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GDPD3Q7L5L3 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GDPD3Q7L5L3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GDPD3Q7L5L3 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GDPD3Q7L5L3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GDPD3Q7L5L3 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GDPD3Q7L5L3 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GDPD3Q7L5L3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GDPD3Q7L5L3 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GDPD3Q7L5L3 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GDPD3Q7L5L3 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GDPD3Q7L5L3 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GDPD3Q7L5L3 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GDPD3Q7L5L3 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GDPD3Q7L5L3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GDPD3Q7L5L3 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GDPD3Q7L5L3 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GDPD3Q7L5L3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GDPD3Q7L5L3 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GDPD3Q7L5L3 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GDPD3Q7L5L3 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GDPD3Q7L5L3 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GDPD3Q7L5L3 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GDPD3Q7L5L3 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GDPD3Q7L5L3 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GDPD3Q7L5L3 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GDPD3Q7L5L3 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GDPD3Q7L5L3 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GDPD3Q7L5L3 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GDPD3Q7L5L3 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GDPD3Q7L5L3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GDPD3Q7L5L3 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GDPD3Q7L5L3 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GDPD3Q7L5L3 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GDPD3Q7L5L3 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GDPD3Q7L5L3 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GDPD3Q7L5L3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GDPD3Q7L5L3 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
GDPD3Q7L5L3 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GDPD3Q7L5L3 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GDPD3Q7L5L3 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GDPD3Q7L5L3 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GDPD3Q7L5L3 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GDPD3Q7L5L3 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GDPD3Q7L5L3 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GDPD3Q7L5L3 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GDPD3Q7L5L3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GDPD3Q7L5L3 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
GDPD3Q7L5L3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
GDPD3Q7L5L3 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GDPD3Q7L5L3 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GDPD3Q7L5L3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GDPD3Q7L5L3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GDPD3Q7L5L3 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GDPD3Q7L5L3 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GDPD3Q7L5L3 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GDPD3Q7L5L3 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GDPD3Q7L5L3 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GDPD3Q7L5L3 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GDPD3Q7L5L3 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GDPD3Q7L5L3 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GDPD3Q7L5L3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GDPD3Q7L5L3 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GDPD3Q7L5L3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GDPD3Q7L5L3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
GDPD3Q7L5L3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GDPD3Q7L5L3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GDPD3Q7L5L3 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GDPD3Q7L5L3 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GDPD3Q7L5L3 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GDPD3Q7L5L3 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GDPD3Q7L5L3 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GDPD3Q7L5L3 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GDPD3Q7L5L3 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GDPD3Q7L5L3 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GDPD3Q7L5L3 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GDPD3Q7L5L3 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GDPD3Q7L5L3 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms