Protein–RNA interactions for Protein: Q71RG4

TMUB2, Transmembrane and ubiquitin-like domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMUB2Q71RG4 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMUB2Q71RG4 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMUB2Q71RG4 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMUB2Q71RG4 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMUB2Q71RG4 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMUB2Q71RG4 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMUB2Q71RG4 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMUB2Q71RG4 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMUB2Q71RG4 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMUB2Q71RG4 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMUB2Q71RG4 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMUB2Q71RG4 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMUB2Q71RG4 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMUB2Q71RG4 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMUB2Q71RG4 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMUB2Q71RG4 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMUB2Q71RG4 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMUB2Q71RG4 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMUB2Q71RG4 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMUB2Q71RG4 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMUB2Q71RG4 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMUB2Q71RG4 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMUB2Q71RG4 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMUB2Q71RG4 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMUB2Q71RG4 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMUB2Q71RG4 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMUB2Q71RG4 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMUB2Q71RG4 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMUB2Q71RG4 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMUB2Q71RG4 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMUB2Q71RG4 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMUB2Q71RG4 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMUB2Q71RG4 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TMUB2Q71RG4 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMUB2Q71RG4 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMUB2Q71RG4 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMUB2Q71RG4 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMUB2Q71RG4 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMUB2Q71RG4 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMUB2Q71RG4 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMUB2Q71RG4 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TMUB2Q71RG4 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMUB2Q71RG4 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMUB2Q71RG4 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMUB2Q71RG4 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMUB2Q71RG4 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMUB2Q71RG4 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMUB2Q71RG4 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMUB2Q71RG4 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMUB2Q71RG4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMUB2Q71RG4 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TMUB2Q71RG4 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMUB2Q71RG4 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMUB2Q71RG4 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMUB2Q71RG4 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMUB2Q71RG4 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMUB2Q71RG4 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMUB2Q71RG4 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMUB2Q71RG4 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMUB2Q71RG4 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMUB2Q71RG4 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMUB2Q71RG4 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMUB2Q71RG4 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMUB2Q71RG4 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMUB2Q71RG4 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMUB2Q71RG4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMUB2Q71RG4 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TMUB2Q71RG4 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMUB2Q71RG4 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
TMUB2Q71RG4 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
TMUB2Q71RG4 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
TMUB2Q71RG4 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMUB2Q71RG4 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMUB2Q71RG4 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMUB2Q71RG4 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMUB2Q71RG4 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TMUB2Q71RG4 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMUB2Q71RG4 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMUB2Q71RG4 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMUB2Q71RG4 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMUB2Q71RG4 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMUB2Q71RG4 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TMUB2Q71RG4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMUB2Q71RG4 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMUB2Q71RG4 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMUB2Q71RG4 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
TMUB2Q71RG4 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMUB2Q71RG4 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMUB2Q71RG4 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMUB2Q71RG4 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMUB2Q71RG4 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMUB2Q71RG4 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMUB2Q71RG4 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMUB2Q71RG4 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMUB2Q71RG4 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMUB2Q71RG4 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMUB2Q71RG4 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMUB2Q71RG4 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMUB2Q71RG4 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMUB2Q71RG4 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms