Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV50

RFX8, DNA-binding protein RFX8, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX8Q6ZV50 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RFX8Q6ZV50 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RFX8Q6ZV50 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RFX8Q6ZV50 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RFX8Q6ZV50 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RFX8Q6ZV50 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RFX8Q6ZV50 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RFX8Q6ZV50 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RFX8Q6ZV50 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RFX8Q6ZV50 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RFX8Q6ZV50 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RFX8Q6ZV50 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RFX8Q6ZV50 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RFX8Q6ZV50 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RFX8Q6ZV50 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RFX8Q6ZV50 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RFX8Q6ZV50 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RFX8Q6ZV50 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RFX8Q6ZV50 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RFX8Q6ZV50 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RFX8Q6ZV50 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RFX8Q6ZV50 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RFX8Q6ZV50 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RFX8Q6ZV50 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RFX8Q6ZV50 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RFX8Q6ZV50 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RFX8Q6ZV50 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RFX8Q6ZV50 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RFX8Q6ZV50 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RFX8Q6ZV50 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RFX8Q6ZV50 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RFX8Q6ZV50 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RFX8Q6ZV50 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RFX8Q6ZV50 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RFX8Q6ZV50 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RFX8Q6ZV50 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RFX8Q6ZV50 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RFX8Q6ZV50 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RFX8Q6ZV50 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RFX8Q6ZV50 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RFX8Q6ZV50 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RFX8Q6ZV50 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RFX8Q6ZV50 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RFX8Q6ZV50 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RFX8Q6ZV50 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RFX8Q6ZV50 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RFX8Q6ZV50 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RFX8Q6ZV50 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RFX8Q6ZV50 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RFX8Q6ZV50 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RFX8Q6ZV50 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RFX8Q6ZV50 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RFX8Q6ZV50 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RFX8Q6ZV50 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RFX8Q6ZV50 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RFX8Q6ZV50 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RFX8Q6ZV50 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RFX8Q6ZV50 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RFX8Q6ZV50 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RFX8Q6ZV50 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RFX8Q6ZV50 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RFX8Q6ZV50 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RFX8Q6ZV50 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RFX8Q6ZV50 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RFX8Q6ZV50 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RFX8Q6ZV50 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RFX8Q6ZV50 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RFX8Q6ZV50 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RFX8Q6ZV50 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RFX8Q6ZV50 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RFX8Q6ZV50 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RFX8Q6ZV50 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RFX8Q6ZV50 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RFX8Q6ZV50 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RFX8Q6ZV50 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RFX8Q6ZV50 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RFX8Q6ZV50 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RFX8Q6ZV50 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RFX8Q6ZV50 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RFX8Q6ZV50 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RFX8Q6ZV50 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RFX8Q6ZV50 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RFX8Q6ZV50 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RFX8Q6ZV50 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RFX8Q6ZV50 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RFX8Q6ZV50 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RFX8Q6ZV50 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RFX8Q6ZV50 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RFX8Q6ZV50 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RFX8Q6ZV50 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RFX8Q6ZV50 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RFX8Q6ZV50 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RFX8Q6ZV50 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RFX8Q6ZV50 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RFX8Q6ZV50 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RFX8Q6ZV50 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RFX8Q6ZV50 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RFX8Q6ZV50 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RFX8Q6ZV50 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RFX8Q6ZV50 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms