Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUT9

DENND5B, DENN domain-containing protein 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND5BQ6ZUT9 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DENND5BQ6ZUT9 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DENND5BQ6ZUT9 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DENND5BQ6ZUT9 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DENND5BQ6ZUT9 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DENND5BQ6ZUT9 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DENND5BQ6ZUT9 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DENND5BQ6ZUT9 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DENND5BQ6ZUT9 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DENND5BQ6ZUT9 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DENND5BQ6ZUT9 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DENND5BQ6ZUT9 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DENND5BQ6ZUT9 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DENND5BQ6ZUT9 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
DENND5BQ6ZUT9 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DENND5BQ6ZUT9 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
DENND5BQ6ZUT9 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DENND5BQ6ZUT9 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DENND5BQ6ZUT9 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DENND5BQ6ZUT9 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DENND5BQ6ZUT9 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DENND5BQ6ZUT9 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
DENND5BQ6ZUT9 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DENND5BQ6ZUT9 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DENND5BQ6ZUT9 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DENND5BQ6ZUT9 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
DENND5BQ6ZUT9 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DENND5BQ6ZUT9 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DENND5BQ6ZUT9 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DENND5BQ6ZUT9 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
DENND5BQ6ZUT9 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DENND5BQ6ZUT9 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DENND5BQ6ZUT9 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
DENND5BQ6ZUT9 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
DENND5BQ6ZUT9 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DENND5BQ6ZUT9 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DENND5BQ6ZUT9 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DENND5BQ6ZUT9 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DENND5BQ6ZUT9 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DENND5BQ6ZUT9 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DENND5BQ6ZUT9 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
DENND5BQ6ZUT9 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DENND5BQ6ZUT9 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DENND5BQ6ZUT9 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DENND5BQ6ZUT9 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DENND5BQ6ZUT9 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DENND5BQ6ZUT9 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DENND5BQ6ZUT9 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DENND5BQ6ZUT9 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DENND5BQ6ZUT9 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DENND5BQ6ZUT9 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DENND5BQ6ZUT9 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DENND5BQ6ZUT9 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DENND5BQ6ZUT9 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
DENND5BQ6ZUT9 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DENND5BQ6ZUT9 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DENND5BQ6ZUT9 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DENND5BQ6ZUT9 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DENND5BQ6ZUT9 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DENND5BQ6ZUT9 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DENND5BQ6ZUT9 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DENND5BQ6ZUT9 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DENND5BQ6ZUT9 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DENND5BQ6ZUT9 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DENND5BQ6ZUT9 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DENND5BQ6ZUT9 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DENND5BQ6ZUT9 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DENND5BQ6ZUT9 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DENND5BQ6ZUT9 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DENND5BQ6ZUT9 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DENND5BQ6ZUT9 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DENND5BQ6ZUT9 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DENND5BQ6ZUT9 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DENND5BQ6ZUT9 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DENND5BQ6ZUT9 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DENND5BQ6ZUT9 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
DENND5BQ6ZUT9 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DENND5BQ6ZUT9 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DENND5BQ6ZUT9 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DENND5BQ6ZUT9 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DENND5BQ6ZUT9 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DENND5BQ6ZUT9 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DENND5BQ6ZUT9 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DENND5BQ6ZUT9 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DENND5BQ6ZUT9 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DENND5BQ6ZUT9 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DENND5BQ6ZUT9 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DENND5BQ6ZUT9 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DENND5BQ6ZUT9 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DENND5BQ6ZUT9 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DENND5BQ6ZUT9 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DENND5BQ6ZUT9 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DENND5BQ6ZUT9 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
DENND5BQ6ZUT9 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DENND5BQ6ZUT9 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DENND5BQ6ZUT9 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DENND5BQ6ZUT9 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DENND5BQ6ZUT9 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DENND5BQ6ZUT9 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DENND5BQ6ZUT9 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms