Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZP82

CCDC141, Coiled-coil domain-containing protein 141, humanhuman

Predictions only

Length 1,450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC141Q6ZP82 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
CCDC141Q6ZP82 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
CCDC141Q6ZP82 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
CCDC141Q6ZP82 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
CCDC141Q6ZP82 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
CCDC141Q6ZP82 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
CCDC141Q6ZP82 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
CCDC141Q6ZP82 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
CCDC141Q6ZP82 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
CCDC141Q6ZP82 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
CCDC141Q6ZP82 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
CCDC141Q6ZP82 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
CCDC141Q6ZP82 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
CCDC141Q6ZP82 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
CCDC141Q6ZP82 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
CCDC141Q6ZP82 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.88
CCDC141Q6ZP82 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.88
CCDC141Q6ZP82 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC33.01■■■□□ 2.88
CCDC141Q6ZP82 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
CCDC141Q6ZP82 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC33.01■■■□□ 2.88
CCDC141Q6ZP82 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC33.01■■■□□ 2.88
CCDC141Q6ZP82 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC33.01■■■□□ 2.88
CCDC141Q6ZP82 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
CCDC141Q6ZP82 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
CCDC141Q6ZP82 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC33■■■□□ 2.87
CCDC141Q6ZP82 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
CCDC141Q6ZP82 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
CCDC141Q6ZP82 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
CCDC141Q6ZP82 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
CCDC141Q6ZP82 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
CCDC141Q6ZP82 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
CCDC141Q6ZP82 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
CCDC141Q6ZP82 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
CCDC141Q6ZP82 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
CCDC141Q6ZP82 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
CCDC141Q6ZP82 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
CCDC141Q6ZP82 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
CCDC141Q6ZP82 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
CCDC141Q6ZP82 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
CCDC141Q6ZP82 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
CCDC141Q6ZP82 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
CCDC141Q6ZP82 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
CCDC141Q6ZP82 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
CCDC141Q6ZP82 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
CCDC141Q6ZP82 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
CCDC141Q6ZP82 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
CCDC141Q6ZP82 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
CCDC141Q6ZP82 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC32.98■■■□□ 2.87
CCDC141Q6ZP82 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
CCDC141Q6ZP82 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
CCDC141Q6ZP82 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
CCDC141Q6ZP82 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
CCDC141Q6ZP82 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
CCDC141Q6ZP82 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
CCDC141Q6ZP82 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
CCDC141Q6ZP82 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
CCDC141Q6ZP82 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
CCDC141Q6ZP82 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
CCDC141Q6ZP82 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
CCDC141Q6ZP82 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
CCDC141Q6ZP82 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
CCDC141Q6ZP82 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
CCDC141Q6ZP82 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
CCDC141Q6ZP82 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
CCDC141Q6ZP82 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
CCDC141Q6ZP82 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
CCDC141Q6ZP82 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
CCDC141Q6ZP82 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
CCDC141Q6ZP82 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
CCDC141Q6ZP82 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
CCDC141Q6ZP82 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
CCDC141Q6ZP82 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
CCDC141Q6ZP82 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
CCDC141Q6ZP82 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
CCDC141Q6ZP82 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC32.93■■■□□ 2.86
CCDC141Q6ZP82 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
CCDC141Q6ZP82 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
CCDC141Q6ZP82 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
CCDC141Q6ZP82 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
CCDC141Q6ZP82 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
CCDC141Q6ZP82 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
CCDC141Q6ZP82 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.92■■■□□ 2.86
CCDC141Q6ZP82 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
CCDC141Q6ZP82 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
CCDC141Q6ZP82 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
CCDC141Q6ZP82 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
CCDC141Q6ZP82 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
CCDC141Q6ZP82 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC32.91■■■□□ 2.86
CCDC141Q6ZP82 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
CCDC141Q6ZP82 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
CCDC141Q6ZP82 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC32.91■■■□□ 2.86
CCDC141Q6ZP82 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
CCDC141Q6ZP82 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
CCDC141Q6ZP82 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
CCDC141Q6ZP82 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
CCDC141Q6ZP82 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.9■■■□□ 2.86
CCDC141Q6ZP82 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
CCDC141Q6ZP82 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
CCDC141Q6ZP82 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
CCDC141Q6ZP82 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms