Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMN7

PDZRN4, PDZ domain-containing RING finger protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN4Q6ZMN7 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PDZRN4Q6ZMN7 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PDZRN4Q6ZMN7 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PDZRN4Q6ZMN7 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PDZRN4Q6ZMN7 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PDZRN4Q6ZMN7 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PDZRN4Q6ZMN7 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
PDZRN4Q6ZMN7 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PDZRN4Q6ZMN7 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PDZRN4Q6ZMN7 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PDZRN4Q6ZMN7 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PDZRN4Q6ZMN7 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PDZRN4Q6ZMN7 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PDZRN4Q6ZMN7 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDZRN4Q6ZMN7 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDZRN4Q6ZMN7 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDZRN4Q6ZMN7 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PDZRN4Q6ZMN7 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDZRN4Q6ZMN7 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PDZRN4Q6ZMN7 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDZRN4Q6ZMN7 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDZRN4Q6ZMN7 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDZRN4Q6ZMN7 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDZRN4Q6ZMN7 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDZRN4Q6ZMN7 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDZRN4Q6ZMN7 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDZRN4Q6ZMN7 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDZRN4Q6ZMN7 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDZRN4Q6ZMN7 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDZRN4Q6ZMN7 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDZRN4Q6ZMN7 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDZRN4Q6ZMN7 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDZRN4Q6ZMN7 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDZRN4Q6ZMN7 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDZRN4Q6ZMN7 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PDZRN4Q6ZMN7 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDZRN4Q6ZMN7 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDZRN4Q6ZMN7 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDZRN4Q6ZMN7 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDZRN4Q6ZMN7 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDZRN4Q6ZMN7 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDZRN4Q6ZMN7 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDZRN4Q6ZMN7 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDZRN4Q6ZMN7 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDZRN4Q6ZMN7 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDZRN4Q6ZMN7 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDZRN4Q6ZMN7 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDZRN4Q6ZMN7 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDZRN4Q6ZMN7 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDZRN4Q6ZMN7 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDZRN4Q6ZMN7 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDZRN4Q6ZMN7 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDZRN4Q6ZMN7 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDZRN4Q6ZMN7 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDZRN4Q6ZMN7 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDZRN4Q6ZMN7 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDZRN4Q6ZMN7 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDZRN4Q6ZMN7 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDZRN4Q6ZMN7 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDZRN4Q6ZMN7 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDZRN4Q6ZMN7 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDZRN4Q6ZMN7 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDZRN4Q6ZMN7 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDZRN4Q6ZMN7 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDZRN4Q6ZMN7 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDZRN4Q6ZMN7 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDZRN4Q6ZMN7 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDZRN4Q6ZMN7 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDZRN4Q6ZMN7 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDZRN4Q6ZMN7 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDZRN4Q6ZMN7 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDZRN4Q6ZMN7 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDZRN4Q6ZMN7 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDZRN4Q6ZMN7 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDZRN4Q6ZMN7 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDZRN4Q6ZMN7 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDZRN4Q6ZMN7 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDZRN4Q6ZMN7 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDZRN4Q6ZMN7 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDZRN4Q6ZMN7 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDZRN4Q6ZMN7 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDZRN4Q6ZMN7 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDZRN4Q6ZMN7 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDZRN4Q6ZMN7 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDZRN4Q6ZMN7 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDZRN4Q6ZMN7 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDZRN4Q6ZMN7 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDZRN4Q6ZMN7 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDZRN4Q6ZMN7 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDZRN4Q6ZMN7 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDZRN4Q6ZMN7 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDZRN4Q6ZMN7 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDZRN4Q6ZMN7 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDZRN4Q6ZMN7 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDZRN4Q6ZMN7 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDZRN4Q6ZMN7 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PDZRN4Q6ZMN7 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDZRN4Q6ZMN7 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDZRN4Q6ZMN7 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDZRN4Q6ZMN7 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms