Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMJ2

SCARA5, Scavenger receptor class A member 5, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARA5Q6ZMJ2 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCARA5Q6ZMJ2 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCARA5Q6ZMJ2 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCARA5Q6ZMJ2 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCARA5Q6ZMJ2 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCARA5Q6ZMJ2 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCARA5Q6ZMJ2 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCARA5Q6ZMJ2 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCARA5Q6ZMJ2 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCARA5Q6ZMJ2 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCARA5Q6ZMJ2 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCARA5Q6ZMJ2 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCARA5Q6ZMJ2 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCARA5Q6ZMJ2 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCARA5Q6ZMJ2 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCARA5Q6ZMJ2 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCARA5Q6ZMJ2 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCARA5Q6ZMJ2 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCARA5Q6ZMJ2 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCARA5Q6ZMJ2 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCARA5Q6ZMJ2 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCARA5Q6ZMJ2 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCARA5Q6ZMJ2 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCARA5Q6ZMJ2 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCARA5Q6ZMJ2 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCARA5Q6ZMJ2 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCARA5Q6ZMJ2 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCARA5Q6ZMJ2 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCARA5Q6ZMJ2 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCARA5Q6ZMJ2 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SCARA5Q6ZMJ2 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCARA5Q6ZMJ2 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCARA5Q6ZMJ2 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCARA5Q6ZMJ2 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCARA5Q6ZMJ2 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCARA5Q6ZMJ2 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCARA5Q6ZMJ2 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCARA5Q6ZMJ2 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCARA5Q6ZMJ2 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCARA5Q6ZMJ2 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCARA5Q6ZMJ2 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCARA5Q6ZMJ2 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCARA5Q6ZMJ2 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCARA5Q6ZMJ2 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCARA5Q6ZMJ2 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCARA5Q6ZMJ2 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SCARA5Q6ZMJ2 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCARA5Q6ZMJ2 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCARA5Q6ZMJ2 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SCARA5Q6ZMJ2 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
SCARA5Q6ZMJ2 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SCARA5Q6ZMJ2 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SCARA5Q6ZMJ2 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCARA5Q6ZMJ2 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCARA5Q6ZMJ2 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCARA5Q6ZMJ2 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCARA5Q6ZMJ2 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCARA5Q6ZMJ2 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCARA5Q6ZMJ2 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCARA5Q6ZMJ2 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCARA5Q6ZMJ2 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCARA5Q6ZMJ2 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCARA5Q6ZMJ2 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCARA5Q6ZMJ2 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCARA5Q6ZMJ2 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCARA5Q6ZMJ2 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCARA5Q6ZMJ2 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SCARA5Q6ZMJ2 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCARA5Q6ZMJ2 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCARA5Q6ZMJ2 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCARA5Q6ZMJ2 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCARA5Q6ZMJ2 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCARA5Q6ZMJ2 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCARA5Q6ZMJ2 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCARA5Q6ZMJ2 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCARA5Q6ZMJ2 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCARA5Q6ZMJ2 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCARA5Q6ZMJ2 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCARA5Q6ZMJ2 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCARA5Q6ZMJ2 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCARA5Q6ZMJ2 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCARA5Q6ZMJ2 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCARA5Q6ZMJ2 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SCARA5Q6ZMJ2 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCARA5Q6ZMJ2 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCARA5Q6ZMJ2 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCARA5Q6ZMJ2 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCARA5Q6ZMJ2 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCARA5Q6ZMJ2 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCARA5Q6ZMJ2 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SCARA5Q6ZMJ2 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCARA5Q6ZMJ2 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCARA5Q6ZMJ2 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCARA5Q6ZMJ2 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCARA5Q6ZMJ2 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCARA5Q6ZMJ2 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCARA5Q6ZMJ2 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SCARA5Q6ZMJ2 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCARA5Q6ZMJ2 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCARA5Q6ZMJ2 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms