Protein–RNA interactions for Protein: Q6XYB7

LBX2, Transcription factor LBX2, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LBX2Q6XYB7 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LBX2Q6XYB7 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LBX2Q6XYB7 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LBX2Q6XYB7 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LBX2Q6XYB7 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LBX2Q6XYB7 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LBX2Q6XYB7 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LBX2Q6XYB7 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LBX2Q6XYB7 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LBX2Q6XYB7 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LBX2Q6XYB7 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LBX2Q6XYB7 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LBX2Q6XYB7 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LBX2Q6XYB7 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LBX2Q6XYB7 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
LBX2Q6XYB7 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LBX2Q6XYB7 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LBX2Q6XYB7 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LBX2Q6XYB7 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LBX2Q6XYB7 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
LBX2Q6XYB7 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
LBX2Q6XYB7 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LBX2Q6XYB7 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LBX2Q6XYB7 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LBX2Q6XYB7 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LBX2Q6XYB7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LBX2Q6XYB7 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LBX2Q6XYB7 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LBX2Q6XYB7 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LBX2Q6XYB7 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LBX2Q6XYB7 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LBX2Q6XYB7 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LBX2Q6XYB7 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
LBX2Q6XYB7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LBX2Q6XYB7 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LBX2Q6XYB7 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LBX2Q6XYB7 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LBX2Q6XYB7 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LBX2Q6XYB7 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LBX2Q6XYB7 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LBX2Q6XYB7 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LBX2Q6XYB7 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
LBX2Q6XYB7 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LBX2Q6XYB7 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LBX2Q6XYB7 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LBX2Q6XYB7 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
LBX2Q6XYB7 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
LBX2Q6XYB7 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LBX2Q6XYB7 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LBX2Q6XYB7 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LBX2Q6XYB7 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LBX2Q6XYB7 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
LBX2Q6XYB7 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LBX2Q6XYB7 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LBX2Q6XYB7 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LBX2Q6XYB7 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LBX2Q6XYB7 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LBX2Q6XYB7 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LBX2Q6XYB7 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LBX2Q6XYB7 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LBX2Q6XYB7 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LBX2Q6XYB7 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LBX2Q6XYB7 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LBX2Q6XYB7 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
LBX2Q6XYB7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LBX2Q6XYB7 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LBX2Q6XYB7 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LBX2Q6XYB7 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
LBX2Q6XYB7 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LBX2Q6XYB7 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LBX2Q6XYB7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LBX2Q6XYB7 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
LBX2Q6XYB7 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LBX2Q6XYB7 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LBX2Q6XYB7 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LBX2Q6XYB7 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LBX2Q6XYB7 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LBX2Q6XYB7 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LBX2Q6XYB7 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LBX2Q6XYB7 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LBX2Q6XYB7 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LBX2Q6XYB7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LBX2Q6XYB7 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LBX2Q6XYB7 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LBX2Q6XYB7 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LBX2Q6XYB7 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LBX2Q6XYB7 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LBX2Q6XYB7 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LBX2Q6XYB7 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LBX2Q6XYB7 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
LBX2Q6XYB7 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LBX2Q6XYB7 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LBX2Q6XYB7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LBX2Q6XYB7 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LBX2Q6XYB7 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LBX2Q6XYB7 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LBX2Q6XYB7 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LBX2Q6XYB7 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LBX2Q6XYB7 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LBX2Q6XYB7 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms