Protein–RNA interactions for Protein: Q6VN20

RANBP10, Ran-binding protein 10, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANBP10Q6VN20 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RANBP10Q6VN20 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RANBP10Q6VN20 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RANBP10Q6VN20 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RANBP10Q6VN20 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RANBP10Q6VN20 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RANBP10Q6VN20 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RANBP10Q6VN20 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RANBP10Q6VN20 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RANBP10Q6VN20 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RANBP10Q6VN20 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RANBP10Q6VN20 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RANBP10Q6VN20 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RANBP10Q6VN20 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RANBP10Q6VN20 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RANBP10Q6VN20 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RANBP10Q6VN20 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
RANBP10Q6VN20 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RANBP10Q6VN20 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RANBP10Q6VN20 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RANBP10Q6VN20 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RANBP10Q6VN20 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RANBP10Q6VN20 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RANBP10Q6VN20 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RANBP10Q6VN20 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RANBP10Q6VN20 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RANBP10Q6VN20 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RANBP10Q6VN20 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RANBP10Q6VN20 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RANBP10Q6VN20 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RANBP10Q6VN20 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RANBP10Q6VN20 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RANBP10Q6VN20 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RANBP10Q6VN20 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RANBP10Q6VN20 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RANBP10Q6VN20 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RANBP10Q6VN20 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RANBP10Q6VN20 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RANBP10Q6VN20 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RANBP10Q6VN20 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RANBP10Q6VN20 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RANBP10Q6VN20 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RANBP10Q6VN20 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RANBP10Q6VN20 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RANBP10Q6VN20 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RANBP10Q6VN20 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RANBP10Q6VN20 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RANBP10Q6VN20 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RANBP10Q6VN20 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RANBP10Q6VN20 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RANBP10Q6VN20 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RANBP10Q6VN20 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RANBP10Q6VN20 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RANBP10Q6VN20 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RANBP10Q6VN20 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RANBP10Q6VN20 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RANBP10Q6VN20 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RANBP10Q6VN20 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RANBP10Q6VN20 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RANBP10Q6VN20 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RANBP10Q6VN20 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RANBP10Q6VN20 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RANBP10Q6VN20 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RANBP10Q6VN20 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RANBP10Q6VN20 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RANBP10Q6VN20 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RANBP10Q6VN20 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RANBP10Q6VN20 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RANBP10Q6VN20 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RANBP10Q6VN20 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RANBP10Q6VN20 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RANBP10Q6VN20 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RANBP10Q6VN20 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RANBP10Q6VN20 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RANBP10Q6VN20 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RANBP10Q6VN20 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RANBP10Q6VN20 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RANBP10Q6VN20 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RANBP10Q6VN20 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RANBP10Q6VN20 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RANBP10Q6VN20 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RANBP10Q6VN20 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RANBP10Q6VN20 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RANBP10Q6VN20 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RANBP10Q6VN20 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RANBP10Q6VN20 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RANBP10Q6VN20 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RANBP10Q6VN20 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RANBP10Q6VN20 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RANBP10Q6VN20 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RANBP10Q6VN20 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RANBP10Q6VN20 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RANBP10Q6VN20 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RANBP10Q6VN20 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RANBP10Q6VN20 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RANBP10Q6VN20 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RANBP10Q6VN20 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RANBP10Q6VN20 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RANBP10Q6VN20 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
RANBP10Q6VN20 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms