Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCBE1Q6UXH8 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCBE1Q6UXH8 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCBE1Q6UXH8 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCBE1Q6UXH8 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCBE1Q6UXH8 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCBE1Q6UXH8 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CCBE1Q6UXH8 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CCBE1Q6UXH8 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CCBE1Q6UXH8 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CCBE1Q6UXH8 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCBE1Q6UXH8 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCBE1Q6UXH8 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCBE1Q6UXH8 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCBE1Q6UXH8 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCBE1Q6UXH8 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCBE1Q6UXH8 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCBE1Q6UXH8 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCBE1Q6UXH8 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CCBE1Q6UXH8 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCBE1Q6UXH8 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCBE1Q6UXH8 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CCBE1Q6UXH8 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCBE1Q6UXH8 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCBE1Q6UXH8 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCBE1Q6UXH8 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCBE1Q6UXH8 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCBE1Q6UXH8 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCBE1Q6UXH8 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCBE1Q6UXH8 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCBE1Q6UXH8 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCBE1Q6UXH8 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCBE1Q6UXH8 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCBE1Q6UXH8 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCBE1Q6UXH8 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCBE1Q6UXH8 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCBE1Q6UXH8 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCBE1Q6UXH8 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCBE1Q6UXH8 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCBE1Q6UXH8 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCBE1Q6UXH8 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCBE1Q6UXH8 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCBE1Q6UXH8 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCBE1Q6UXH8 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCBE1Q6UXH8 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CCBE1Q6UXH8 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCBE1Q6UXH8 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCBE1Q6UXH8 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCBE1Q6UXH8 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCBE1Q6UXH8 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCBE1Q6UXH8 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCBE1Q6UXH8 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCBE1Q6UXH8 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCBE1Q6UXH8 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCBE1Q6UXH8 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCBE1Q6UXH8 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCBE1Q6UXH8 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCBE1Q6UXH8 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCBE1Q6UXH8 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CCBE1Q6UXH8 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCBE1Q6UXH8 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCBE1Q6UXH8 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCBE1Q6UXH8 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCBE1Q6UXH8 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CCBE1Q6UXH8 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCBE1Q6UXH8 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCBE1Q6UXH8 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCBE1Q6UXH8 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCBE1Q6UXH8 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCBE1Q6UXH8 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCBE1Q6UXH8 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCBE1Q6UXH8 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCBE1Q6UXH8 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCBE1Q6UXH8 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCBE1Q6UXH8 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCBE1Q6UXH8 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCBE1Q6UXH8 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCBE1Q6UXH8 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCBE1Q6UXH8 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCBE1Q6UXH8 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCBE1Q6UXH8 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCBE1Q6UXH8 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCBE1Q6UXH8 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCBE1Q6UXH8 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCBE1Q6UXH8 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCBE1Q6UXH8 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCBE1Q6UXH8 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCBE1Q6UXH8 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCBE1Q6UXH8 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCBE1Q6UXH8 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCBE1Q6UXH8 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCBE1Q6UXH8 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCBE1Q6UXH8 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCBE1Q6UXH8 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCBE1Q6UXH8 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCBE1Q6UXH8 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCBE1Q6UXH8 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCBE1Q6UXH8 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCBE1Q6UXH8 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCBE1Q6UXH8 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms