Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWL2

SUSD1, Sushi domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD1Q6UWL2 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SUSD1Q6UWL2 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SUSD1Q6UWL2 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SUSD1Q6UWL2 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SUSD1Q6UWL2 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SUSD1Q6UWL2 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SUSD1Q6UWL2 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SUSD1Q6UWL2 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SUSD1Q6UWL2 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SUSD1Q6UWL2 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SUSD1Q6UWL2 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SUSD1Q6UWL2 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SUSD1Q6UWL2 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SUSD1Q6UWL2 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SUSD1Q6UWL2 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SUSD1Q6UWL2 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SUSD1Q6UWL2 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SUSD1Q6UWL2 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SUSD1Q6UWL2 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SUSD1Q6UWL2 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SUSD1Q6UWL2 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SUSD1Q6UWL2 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SUSD1Q6UWL2 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SUSD1Q6UWL2 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SUSD1Q6UWL2 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SUSD1Q6UWL2 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SUSD1Q6UWL2 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SUSD1Q6UWL2 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SUSD1Q6UWL2 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SUSD1Q6UWL2 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SUSD1Q6UWL2 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SUSD1Q6UWL2 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SUSD1Q6UWL2 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SUSD1Q6UWL2 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SUSD1Q6UWL2 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SUSD1Q6UWL2 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SUSD1Q6UWL2 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SUSD1Q6UWL2 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SUSD1Q6UWL2 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SUSD1Q6UWL2 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SUSD1Q6UWL2 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SUSD1Q6UWL2 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SUSD1Q6UWL2 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SUSD1Q6UWL2 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SUSD1Q6UWL2 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SUSD1Q6UWL2 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SUSD1Q6UWL2 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SUSD1Q6UWL2 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SUSD1Q6UWL2 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SUSD1Q6UWL2 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SUSD1Q6UWL2 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SUSD1Q6UWL2 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SUSD1Q6UWL2 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SUSD1Q6UWL2 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SUSD1Q6UWL2 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SUSD1Q6UWL2 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SUSD1Q6UWL2 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SUSD1Q6UWL2 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SUSD1Q6UWL2 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SUSD1Q6UWL2 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SUSD1Q6UWL2 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SUSD1Q6UWL2 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SUSD1Q6UWL2 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SUSD1Q6UWL2 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SUSD1Q6UWL2 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SUSD1Q6UWL2 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SUSD1Q6UWL2 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SUSD1Q6UWL2 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SUSD1Q6UWL2 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SUSD1Q6UWL2 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SUSD1Q6UWL2 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SUSD1Q6UWL2 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SUSD1Q6UWL2 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SUSD1Q6UWL2 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SUSD1Q6UWL2 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SUSD1Q6UWL2 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SUSD1Q6UWL2 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SUSD1Q6UWL2 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SUSD1Q6UWL2 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SUSD1Q6UWL2 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SUSD1Q6UWL2 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SUSD1Q6UWL2 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SUSD1Q6UWL2 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SUSD1Q6UWL2 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SUSD1Q6UWL2 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SUSD1Q6UWL2 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SUSD1Q6UWL2 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SUSD1Q6UWL2 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SUSD1Q6UWL2 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SUSD1Q6UWL2 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SUSD1Q6UWL2 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SUSD1Q6UWL2 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SUSD1Q6UWL2 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SUSD1Q6UWL2 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SUSD1Q6UWL2 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SUSD1Q6UWL2 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SUSD1Q6UWL2 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SUSD1Q6UWL2 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SUSD1Q6UWL2 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SUSD1Q6UWL2 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms