Protein–RNA interactions for Protein: Q6SPF0

SAMD1, Atherin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD1Q6SPF0 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SAMD1Q6SPF0 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SAMD1Q6SPF0 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SAMD1Q6SPF0 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SAMD1Q6SPF0 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SAMD1Q6SPF0 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SAMD1Q6SPF0 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SAMD1Q6SPF0 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SAMD1Q6SPF0 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SAMD1Q6SPF0 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SAMD1Q6SPF0 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SAMD1Q6SPF0 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SAMD1Q6SPF0 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SAMD1Q6SPF0 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SAMD1Q6SPF0 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SAMD1Q6SPF0 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SAMD1Q6SPF0 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SAMD1Q6SPF0 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SAMD1Q6SPF0 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SAMD1Q6SPF0 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SAMD1Q6SPF0 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SAMD1Q6SPF0 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SAMD1Q6SPF0 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SAMD1Q6SPF0 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SAMD1Q6SPF0 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SAMD1Q6SPF0 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SAMD1Q6SPF0 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SAMD1Q6SPF0 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SAMD1Q6SPF0 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SAMD1Q6SPF0 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SAMD1Q6SPF0 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SAMD1Q6SPF0 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SAMD1Q6SPF0 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SAMD1Q6SPF0 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SAMD1Q6SPF0 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SAMD1Q6SPF0 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SAMD1Q6SPF0 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SAMD1Q6SPF0 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SAMD1Q6SPF0 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SAMD1Q6SPF0 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SAMD1Q6SPF0 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SAMD1Q6SPF0 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SAMD1Q6SPF0 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SAMD1Q6SPF0 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SAMD1Q6SPF0 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SAMD1Q6SPF0 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SAMD1Q6SPF0 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SAMD1Q6SPF0 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SAMD1Q6SPF0 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SAMD1Q6SPF0 PAX6-247ENST00000638965 979 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SAMD1Q6SPF0 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SAMD1Q6SPF0 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SAMD1Q6SPF0 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SAMD1Q6SPF0 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SAMD1Q6SPF0 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SAMD1Q6SPF0 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SAMD1Q6SPF0 KRTAP4-4-201ENST00000390661 1081 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SAMD1Q6SPF0 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SAMD1Q6SPF0 LINC00511-205ENST00000578206 908 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SAMD1Q6SPF0 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SAMD1Q6SPF0 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SAMD1Q6SPF0 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SAMD1Q6SPF0 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SAMD1Q6SPF0 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SAMD1Q6SPF0 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SAMD1Q6SPF0 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SAMD1Q6SPF0 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SAMD1Q6SPF0 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SAMD1Q6SPF0 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SAMD1Q6SPF0 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SAMD1Q6SPF0 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SAMD1Q6SPF0 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SAMD1Q6SPF0 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SAMD1Q6SPF0 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SAMD1Q6SPF0 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SAMD1Q6SPF0 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SAMD1Q6SPF0 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SAMD1Q6SPF0 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SAMD1Q6SPF0 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SAMD1Q6SPF0 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SAMD1Q6SPF0 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SAMD1Q6SPF0 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SAMD1Q6SPF0 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SAMD1Q6SPF0 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SAMD1Q6SPF0 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SAMD1Q6SPF0 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SAMD1Q6SPF0 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SAMD1Q6SPF0 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SAMD1Q6SPF0 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SAMD1Q6SPF0 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SAMD1Q6SPF0 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SAMD1Q6SPF0 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SAMD1Q6SPF0 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SAMD1Q6SPF0 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SAMD1Q6SPF0 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SAMD1Q6SPF0 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SAMD1Q6SPF0 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SAMD1Q6SPF0 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SAMD1Q6SPF0 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SAMD1Q6SPF0 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms