Protein–RNA interactions for Protein: Q6P435

Putative uncharacterized SMG1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6P435 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q6P435 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q6P435 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q6P435 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q6P435 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q6P435 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q6P435 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q6P435 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q6P435 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q6P435 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q6P435 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q6P435 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Q6P435 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q6P435 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q6P435 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q6P435 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q6P435 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q6P435 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q6P435 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q6P435 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q6P435 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q6P435 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q6P435 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q6P435 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q6P435 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q6P435 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q6P435 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q6P435 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q6P435 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Q6P435 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q6P435 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q6P435 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q6P435 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q6P435 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q6P435 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q6P435 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q6P435 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q6P435 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q6P435 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q6P435 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Q6P435 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q6P435 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q6P435 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q6P435 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q6P435 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q6P435 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q6P435 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q6P435 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q6P435 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q6P435 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Q6P435 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q6P435 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q6P435 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q6P435 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q6P435 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q6P435 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q6P435 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Q6P435 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q6P435 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q6P435 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q6P435 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q6P435 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q6P435 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q6P435 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q6P435 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q6P435 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q6P435 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q6P435 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q6P435 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q6P435 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q6P435 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q6P435 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q6P435 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q6P435 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q6P435 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q6P435 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q6P435 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q6P435 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q6P435 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q6P435 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q6P435 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q6P435 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q6P435 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q6P435 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q6P435 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q6P435 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q6P435 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q6P435 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q6P435 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q6P435 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q6P435 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q6P435 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Q6P435 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Q6P435 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Q6P435 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q6P435 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q6P435 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Q6P435 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q6P435 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q6P435 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms