Protein–RNA interactions for Protein: Q6NX49

ZNF544, Zinc finger protein 544, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF544Q6NX49 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNF544Q6NX49 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNF544Q6NX49 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNF544Q6NX49 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNF544Q6NX49 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNF544Q6NX49 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNF544Q6NX49 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNF544Q6NX49 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNF544Q6NX49 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNF544Q6NX49 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNF544Q6NX49 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNF544Q6NX49 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ZNF544Q6NX49 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
ZNF544Q6NX49 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ZNF544Q6NX49 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ZNF544Q6NX49 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF544Q6NX49 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF544Q6NX49 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF544Q6NX49 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF544Q6NX49 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF544Q6NX49 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF544Q6NX49 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF544Q6NX49 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF544Q6NX49 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF544Q6NX49 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF544Q6NX49 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF544Q6NX49 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF544Q6NX49 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF544Q6NX49 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF544Q6NX49 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF544Q6NX49 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF544Q6NX49 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF544Q6NX49 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF544Q6NX49 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF544Q6NX49 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF544Q6NX49 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF544Q6NX49 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF544Q6NX49 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNF544Q6NX49 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNF544Q6NX49 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNF544Q6NX49 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNF544Q6NX49 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNF544Q6NX49 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNF544Q6NX49 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNF544Q6NX49 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNF544Q6NX49 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNF544Q6NX49 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNF544Q6NX49 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNF544Q6NX49 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNF544Q6NX49 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNF544Q6NX49 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNF544Q6NX49 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNF544Q6NX49 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZNF544Q6NX49 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZNF544Q6NX49 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZNF544Q6NX49 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZNF544Q6NX49 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZNF544Q6NX49 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZNF544Q6NX49 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZNF544Q6NX49 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZNF544Q6NX49 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZNF544Q6NX49 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZNF544Q6NX49 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZNF544Q6NX49 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZNF544Q6NX49 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZNF544Q6NX49 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZNF544Q6NX49 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZNF544Q6NX49 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZNF544Q6NX49 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZNF544Q6NX49 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZNF544Q6NX49 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZNF544Q6NX49 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZNF544Q6NX49 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZNF544Q6NX49 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZNF544Q6NX49 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZNF544Q6NX49 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZNF544Q6NX49 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZNF544Q6NX49 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZNF544Q6NX49 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZNF544Q6NX49 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZNF544Q6NX49 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZNF544Q6NX49 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
ZNF544Q6NX49 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZNF544Q6NX49 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZNF544Q6NX49 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZNF544Q6NX49 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZNF544Q6NX49 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ZNF544Q6NX49 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ZNF544Q6NX49 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
ZNF544Q6NX49 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ZNF544Q6NX49 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
ZNF544Q6NX49 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ZNF544Q6NX49 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ZNF544Q6NX49 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ZNF544Q6NX49 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ZNF544Q6NX49 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ZNF544Q6NX49 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ZNF544Q6NX49 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ZNF544Q6NX49 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ZNF544Q6NX49 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms