Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVH7

SWSAP1, ATPase SWSAP1, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SWSAP1Q6NVH7 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SWSAP1Q6NVH7 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SWSAP1Q6NVH7 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SWSAP1Q6NVH7 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SWSAP1Q6NVH7 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SWSAP1Q6NVH7 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SWSAP1Q6NVH7 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SWSAP1Q6NVH7 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SWSAP1Q6NVH7 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SWSAP1Q6NVH7 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SWSAP1Q6NVH7 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SWSAP1Q6NVH7 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SWSAP1Q6NVH7 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SWSAP1Q6NVH7 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SWSAP1Q6NVH7 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SWSAP1Q6NVH7 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SWSAP1Q6NVH7 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SWSAP1Q6NVH7 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SWSAP1Q6NVH7 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SWSAP1Q6NVH7 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SWSAP1Q6NVH7 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SWSAP1Q6NVH7 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SWSAP1Q6NVH7 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SWSAP1Q6NVH7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SWSAP1Q6NVH7 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SWSAP1Q6NVH7 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SWSAP1Q6NVH7 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SWSAP1Q6NVH7 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SWSAP1Q6NVH7 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SWSAP1Q6NVH7 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SWSAP1Q6NVH7 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SWSAP1Q6NVH7 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SWSAP1Q6NVH7 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SWSAP1Q6NVH7 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SWSAP1Q6NVH7 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SWSAP1Q6NVH7 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SWSAP1Q6NVH7 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SWSAP1Q6NVH7 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SWSAP1Q6NVH7 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SWSAP1Q6NVH7 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SWSAP1Q6NVH7 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SWSAP1Q6NVH7 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SWSAP1Q6NVH7 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SWSAP1Q6NVH7 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SWSAP1Q6NVH7 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SWSAP1Q6NVH7 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SWSAP1Q6NVH7 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SWSAP1Q6NVH7 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SWSAP1Q6NVH7 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SWSAP1Q6NVH7 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SWSAP1Q6NVH7 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SWSAP1Q6NVH7 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SWSAP1Q6NVH7 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SWSAP1Q6NVH7 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SWSAP1Q6NVH7 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SWSAP1Q6NVH7 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SWSAP1Q6NVH7 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SWSAP1Q6NVH7 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SWSAP1Q6NVH7 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SWSAP1Q6NVH7 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SWSAP1Q6NVH7 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SWSAP1Q6NVH7 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SWSAP1Q6NVH7 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SWSAP1Q6NVH7 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SWSAP1Q6NVH7 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SWSAP1Q6NVH7 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SWSAP1Q6NVH7 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SWSAP1Q6NVH7 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SWSAP1Q6NVH7 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SWSAP1Q6NVH7 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SWSAP1Q6NVH7 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SWSAP1Q6NVH7 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SWSAP1Q6NVH7 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SWSAP1Q6NVH7 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SWSAP1Q6NVH7 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SWSAP1Q6NVH7 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SWSAP1Q6NVH7 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SWSAP1Q6NVH7 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SWSAP1Q6NVH7 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SWSAP1Q6NVH7 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SWSAP1Q6NVH7 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SWSAP1Q6NVH7 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SWSAP1Q6NVH7 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SWSAP1Q6NVH7 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SWSAP1Q6NVH7 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SWSAP1Q6NVH7 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SWSAP1Q6NVH7 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SWSAP1Q6NVH7 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SWSAP1Q6NVH7 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SWSAP1Q6NVH7 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SWSAP1Q6NVH7 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SWSAP1Q6NVH7 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SWSAP1Q6NVH7 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SWSAP1Q6NVH7 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SWSAP1Q6NVH7 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SWSAP1Q6NVH7 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SWSAP1Q6NVH7 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SWSAP1Q6NVH7 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SWSAP1Q6NVH7 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SWSAP1Q6NVH7 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms