Protein–RNA interactions for Protein: Q6IQ49

SDE2, Protein SDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDE2Q6IQ49 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SDE2Q6IQ49 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SDE2Q6IQ49 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SDE2Q6IQ49 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SDE2Q6IQ49 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SDE2Q6IQ49 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SDE2Q6IQ49 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SDE2Q6IQ49 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SDE2Q6IQ49 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SDE2Q6IQ49 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SDE2Q6IQ49 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SDE2Q6IQ49 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SDE2Q6IQ49 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SDE2Q6IQ49 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SDE2Q6IQ49 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SDE2Q6IQ49 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SDE2Q6IQ49 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SDE2Q6IQ49 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SDE2Q6IQ49 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SDE2Q6IQ49 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SDE2Q6IQ49 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SDE2Q6IQ49 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SDE2Q6IQ49 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SDE2Q6IQ49 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SDE2Q6IQ49 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SDE2Q6IQ49 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SDE2Q6IQ49 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SDE2Q6IQ49 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SDE2Q6IQ49 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SDE2Q6IQ49 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SDE2Q6IQ49 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SDE2Q6IQ49 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SDE2Q6IQ49 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SDE2Q6IQ49 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SDE2Q6IQ49 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SDE2Q6IQ49 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SDE2Q6IQ49 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SDE2Q6IQ49 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SDE2Q6IQ49 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SDE2Q6IQ49 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SDE2Q6IQ49 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SDE2Q6IQ49 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SDE2Q6IQ49 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SDE2Q6IQ49 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SDE2Q6IQ49 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SDE2Q6IQ49 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SDE2Q6IQ49 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SDE2Q6IQ49 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SDE2Q6IQ49 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SDE2Q6IQ49 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SDE2Q6IQ49 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SDE2Q6IQ49 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SDE2Q6IQ49 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SDE2Q6IQ49 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SDE2Q6IQ49 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SDE2Q6IQ49 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SDE2Q6IQ49 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SDE2Q6IQ49 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SDE2Q6IQ49 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SDE2Q6IQ49 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SDE2Q6IQ49 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SDE2Q6IQ49 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SDE2Q6IQ49 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SDE2Q6IQ49 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SDE2Q6IQ49 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SDE2Q6IQ49 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SDE2Q6IQ49 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SDE2Q6IQ49 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SDE2Q6IQ49 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SDE2Q6IQ49 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SDE2Q6IQ49 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SDE2Q6IQ49 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SDE2Q6IQ49 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SDE2Q6IQ49 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SDE2Q6IQ49 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SDE2Q6IQ49 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SDE2Q6IQ49 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SDE2Q6IQ49 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SDE2Q6IQ49 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SDE2Q6IQ49 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SDE2Q6IQ49 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SDE2Q6IQ49 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SDE2Q6IQ49 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SDE2Q6IQ49 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SDE2Q6IQ49 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SDE2Q6IQ49 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SDE2Q6IQ49 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SDE2Q6IQ49 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SDE2Q6IQ49 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SDE2Q6IQ49 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SDE2Q6IQ49 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SDE2Q6IQ49 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SDE2Q6IQ49 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SDE2Q6IQ49 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SDE2Q6IQ49 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SDE2Q6IQ49 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SDE2Q6IQ49 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SDE2Q6IQ49 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SDE2Q6IQ49 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SDE2Q6IQ49 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms