Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPU0

CENPP, Centromere protein P, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPPQ6IPU0 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CENPPQ6IPU0 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CENPPQ6IPU0 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CENPPQ6IPU0 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CENPPQ6IPU0 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CENPPQ6IPU0 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CENPPQ6IPU0 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CENPPQ6IPU0 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CENPPQ6IPU0 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CENPPQ6IPU0 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CENPPQ6IPU0 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CENPPQ6IPU0 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CENPPQ6IPU0 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CENPPQ6IPU0 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CENPPQ6IPU0 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CENPPQ6IPU0 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CENPPQ6IPU0 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CENPPQ6IPU0 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CENPPQ6IPU0 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CENPPQ6IPU0 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CENPPQ6IPU0 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CENPPQ6IPU0 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CENPPQ6IPU0 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CENPPQ6IPU0 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CENPPQ6IPU0 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CENPPQ6IPU0 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CENPPQ6IPU0 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CENPPQ6IPU0 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CENPPQ6IPU0 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CENPPQ6IPU0 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CENPPQ6IPU0 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CENPPQ6IPU0 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CENPPQ6IPU0 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CENPPQ6IPU0 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CENPPQ6IPU0 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CENPPQ6IPU0 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CENPPQ6IPU0 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CENPPQ6IPU0 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CENPPQ6IPU0 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CENPPQ6IPU0 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CENPPQ6IPU0 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CENPPQ6IPU0 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CENPPQ6IPU0 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CENPPQ6IPU0 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CENPPQ6IPU0 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CENPPQ6IPU0 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CENPPQ6IPU0 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CENPPQ6IPU0 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CENPPQ6IPU0 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CENPPQ6IPU0 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CENPPQ6IPU0 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CENPPQ6IPU0 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CENPPQ6IPU0 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CENPPQ6IPU0 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CENPPQ6IPU0 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CENPPQ6IPU0 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CENPPQ6IPU0 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CENPPQ6IPU0 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CENPPQ6IPU0 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CENPPQ6IPU0 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CENPPQ6IPU0 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CENPPQ6IPU0 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CENPPQ6IPU0 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CENPPQ6IPU0 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CENPPQ6IPU0 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CENPPQ6IPU0 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CENPPQ6IPU0 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CENPPQ6IPU0 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CENPPQ6IPU0 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CENPPQ6IPU0 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CENPPQ6IPU0 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CENPPQ6IPU0 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CENPPQ6IPU0 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CENPPQ6IPU0 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CENPPQ6IPU0 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CENPPQ6IPU0 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CENPPQ6IPU0 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CENPPQ6IPU0 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CENPPQ6IPU0 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CENPPQ6IPU0 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CENPPQ6IPU0 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CENPPQ6IPU0 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CENPPQ6IPU0 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CENPPQ6IPU0 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CENPPQ6IPU0 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CENPPQ6IPU0 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CENPPQ6IPU0 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CENPPQ6IPU0 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CENPPQ6IPU0 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CENPPQ6IPU0 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CENPPQ6IPU0 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CENPPQ6IPU0 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CENPPQ6IPU0 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CENPPQ6IPU0 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CENPPQ6IPU0 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CENPPQ6IPU0 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CENPPQ6IPU0 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CENPPQ6IPU0 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CENPPQ6IPU0 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CENPPQ6IPU0 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms