Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ANKRD40Q6AI12 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ANKRD40Q6AI12 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ANKRD40Q6AI12 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ANKRD40Q6AI12 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ANKRD40Q6AI12 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ANKRD40Q6AI12 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ANKRD40Q6AI12 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ANKRD40Q6AI12 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ANKRD40Q6AI12 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ANKRD40Q6AI12 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ANKRD40Q6AI12 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ANKRD40Q6AI12 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ANKRD40Q6AI12 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ANKRD40Q6AI12 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ANKRD40Q6AI12 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ANKRD40Q6AI12 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ANKRD40Q6AI12 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ANKRD40Q6AI12 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ANKRD40Q6AI12 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ANKRD40Q6AI12 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ANKRD40Q6AI12 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ANKRD40Q6AI12 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ANKRD40Q6AI12 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ANKRD40Q6AI12 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ANKRD40Q6AI12 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ANKRD40Q6AI12 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ANKRD40Q6AI12 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ANKRD40Q6AI12 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ANKRD40Q6AI12 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ANKRD40Q6AI12 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ANKRD40Q6AI12 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ANKRD40Q6AI12 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ANKRD40Q6AI12 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ANKRD40Q6AI12 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ANKRD40Q6AI12 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ANKRD40Q6AI12 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ANKRD40Q6AI12 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ANKRD40Q6AI12 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ANKRD40Q6AI12 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ANKRD40Q6AI12 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ANKRD40Q6AI12 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ANKRD40Q6AI12 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ANKRD40Q6AI12 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ANKRD40Q6AI12 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ANKRD40Q6AI12 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ANKRD40Q6AI12 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ANKRD40Q6AI12 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ANKRD40Q6AI12 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ANKRD40Q6AI12 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ANKRD40Q6AI12 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ANKRD40Q6AI12 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ANKRD40Q6AI12 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ANKRD40Q6AI12 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ANKRD40Q6AI12 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ANKRD40Q6AI12 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ANKRD40Q6AI12 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ANKRD40Q6AI12 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ANKRD40Q6AI12 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ANKRD40Q6AI12 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ANKRD40Q6AI12 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ANKRD40Q6AI12 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ANKRD40Q6AI12 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ANKRD40Q6AI12 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ANKRD40Q6AI12 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ANKRD40Q6AI12 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ANKRD40Q6AI12 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ANKRD40Q6AI12 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ANKRD40Q6AI12 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ANKRD40Q6AI12 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ANKRD40Q6AI12 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ANKRD40Q6AI12 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ANKRD40Q6AI12 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ANKRD40Q6AI12 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
ANKRD40Q6AI12 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ANKRD40Q6AI12 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ANKRD40Q6AI12 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ANKRD40Q6AI12 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ANKRD40Q6AI12 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ANKRD40Q6AI12 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ANKRD40Q6AI12 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ANKRD40Q6AI12 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ANKRD40Q6AI12 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ANKRD40Q6AI12 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ANKRD40Q6AI12 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ANKRD40Q6AI12 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ANKRD40Q6AI12 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ANKRD40Q6AI12 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ANKRD40Q6AI12 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ANKRD40Q6AI12 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ANKRD40Q6AI12 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ANKRD40Q6AI12 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ANKRD40Q6AI12 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ANKRD40Q6AI12 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ANKRD40Q6AI12 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ANKRD40Q6AI12 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ANKRD40Q6AI12 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ANKRD40Q6AI12 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ANKRD40Q6AI12 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ANKRD40Q6AI12 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms