Protein–RNA interactions for Protein: Q68J44

DUPD1, Dual specificity phosphatase DUPD1, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUPD1Q68J44 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DUPD1Q68J44 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DUPD1Q68J44 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DUPD1Q68J44 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DUPD1Q68J44 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DUPD1Q68J44 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DUPD1Q68J44 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DUPD1Q68J44 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
DUPD1Q68J44 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DUPD1Q68J44 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DUPD1Q68J44 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DUPD1Q68J44 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DUPD1Q68J44 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DUPD1Q68J44 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DUPD1Q68J44 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DUPD1Q68J44 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DUPD1Q68J44 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DUPD1Q68J44 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DUPD1Q68J44 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DUPD1Q68J44 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DUPD1Q68J44 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
DUPD1Q68J44 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DUPD1Q68J44 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DUPD1Q68J44 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DUPD1Q68J44 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DUPD1Q68J44 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DUPD1Q68J44 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DUPD1Q68J44 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DUPD1Q68J44 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.19
DUPD1Q68J44 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
DUPD1Q68J44 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DUPD1Q68J44 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DUPD1Q68J44 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
DUPD1Q68J44 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DUPD1Q68J44 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DUPD1Q68J44 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DUPD1Q68J44 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DUPD1Q68J44 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DUPD1Q68J44 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
DUPD1Q68J44 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
DUPD1Q68J44 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DUPD1Q68J44 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DUPD1Q68J44 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DUPD1Q68J44 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DUPD1Q68J44 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DUPD1Q68J44 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DUPD1Q68J44 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DUPD1Q68J44 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DUPD1Q68J44 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DUPD1Q68J44 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DUPD1Q68J44 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DUPD1Q68J44 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DUPD1Q68J44 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DUPD1Q68J44 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DUPD1Q68J44 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DUPD1Q68J44 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DUPD1Q68J44 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DUPD1Q68J44 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DUPD1Q68J44 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DUPD1Q68J44 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DUPD1Q68J44 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DUPD1Q68J44 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DUPD1Q68J44 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DUPD1Q68J44 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DUPD1Q68J44 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DUPD1Q68J44 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DUPD1Q68J44 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DUPD1Q68J44 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DUPD1Q68J44 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DUPD1Q68J44 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DUPD1Q68J44 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DUPD1Q68J44 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DUPD1Q68J44 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DUPD1Q68J44 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DUPD1Q68J44 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DUPD1Q68J44 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DUPD1Q68J44 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DUPD1Q68J44 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DUPD1Q68J44 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DUPD1Q68J44 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DUPD1Q68J44 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DUPD1Q68J44 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DUPD1Q68J44 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DUPD1Q68J44 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DUPD1Q68J44 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DUPD1Q68J44 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DUPD1Q68J44 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DUPD1Q68J44 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DUPD1Q68J44 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DUPD1Q68J44 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DUPD1Q68J44 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DUPD1Q68J44 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DUPD1Q68J44 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DUPD1Q68J44 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DUPD1Q68J44 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
DUPD1Q68J44 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DUPD1Q68J44 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DUPD1Q68J44 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DUPD1Q68J44 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DUPD1Q68J44 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms