Protein–RNA interactions for Protein: Q68DV7

RNF43, E3 ubiquitin-protein ligase RNF43, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF43Q68DV7 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF43Q68DV7 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF43Q68DV7 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF43Q68DV7 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF43Q68DV7 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF43Q68DV7 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RNF43Q68DV7 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RNF43Q68DV7 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RNF43Q68DV7 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RNF43Q68DV7 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RNF43Q68DV7 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RNF43Q68DV7 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RNF43Q68DV7 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RNF43Q68DV7 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RNF43Q68DV7 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RNF43Q68DV7 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RNF43Q68DV7 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RNF43Q68DV7 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RNF43Q68DV7 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RNF43Q68DV7 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RNF43Q68DV7 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RNF43Q68DV7 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RNF43Q68DV7 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RNF43Q68DV7 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RNF43Q68DV7 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RNF43Q68DV7 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF43Q68DV7 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF43Q68DV7 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF43Q68DV7 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF43Q68DV7 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF43Q68DV7 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF43Q68DV7 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF43Q68DV7 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF43Q68DV7 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF43Q68DV7 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF43Q68DV7 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF43Q68DV7 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF43Q68DV7 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF43Q68DV7 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF43Q68DV7 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF43Q68DV7 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF43Q68DV7 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF43Q68DV7 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF43Q68DV7 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF43Q68DV7 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF43Q68DV7 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF43Q68DV7 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF43Q68DV7 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF43Q68DV7 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF43Q68DV7 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF43Q68DV7 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF43Q68DV7 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF43Q68DV7 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF43Q68DV7 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF43Q68DV7 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF43Q68DV7 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF43Q68DV7 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF43Q68DV7 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF43Q68DV7 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF43Q68DV7 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF43Q68DV7 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF43Q68DV7 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF43Q68DV7 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF43Q68DV7 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF43Q68DV7 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF43Q68DV7 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF43Q68DV7 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF43Q68DV7 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF43Q68DV7 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF43Q68DV7 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF43Q68DV7 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF43Q68DV7 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF43Q68DV7 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF43Q68DV7 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF43Q68DV7 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF43Q68DV7 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF43Q68DV7 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF43Q68DV7 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF43Q68DV7 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF43Q68DV7 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF43Q68DV7 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF43Q68DV7 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF43Q68DV7 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF43Q68DV7 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF43Q68DV7 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF43Q68DV7 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF43Q68DV7 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF43Q68DV7 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF43Q68DV7 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF43Q68DV7 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF43Q68DV7 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF43Q68DV7 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF43Q68DV7 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF43Q68DV7 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF43Q68DV7 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF43Q68DV7 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF43Q68DV7 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF43Q68DV7 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.23
RNF43Q68DV7 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
RNF43Q68DV7 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms