Protein–RNA interactions for Protein: Q68CR1

SEL1L3, Protein sel-1 homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEL1L3Q68CR1 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEL1L3Q68CR1 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEL1L3Q68CR1 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEL1L3Q68CR1 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEL1L3Q68CR1 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEL1L3Q68CR1 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEL1L3Q68CR1 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEL1L3Q68CR1 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEL1L3Q68CR1 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEL1L3Q68CR1 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEL1L3Q68CR1 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEL1L3Q68CR1 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEL1L3Q68CR1 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEL1L3Q68CR1 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEL1L3Q68CR1 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEL1L3Q68CR1 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEL1L3Q68CR1 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEL1L3Q68CR1 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEL1L3Q68CR1 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEL1L3Q68CR1 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEL1L3Q68CR1 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEL1L3Q68CR1 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEL1L3Q68CR1 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEL1L3Q68CR1 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEL1L3Q68CR1 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEL1L3Q68CR1 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEL1L3Q68CR1 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEL1L3Q68CR1 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEL1L3Q68CR1 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SEL1L3Q68CR1 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEL1L3Q68CR1 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEL1L3Q68CR1 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEL1L3Q68CR1 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEL1L3Q68CR1 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEL1L3Q68CR1 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEL1L3Q68CR1 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEL1L3Q68CR1 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEL1L3Q68CR1 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEL1L3Q68CR1 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEL1L3Q68CR1 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SEL1L3Q68CR1 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEL1L3Q68CR1 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEL1L3Q68CR1 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEL1L3Q68CR1 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SEL1L3Q68CR1 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SEL1L3Q68CR1 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEL1L3Q68CR1 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEL1L3Q68CR1 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEL1L3Q68CR1 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEL1L3Q68CR1 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEL1L3Q68CR1 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEL1L3Q68CR1 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEL1L3Q68CR1 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SEL1L3Q68CR1 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEL1L3Q68CR1 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEL1L3Q68CR1 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEL1L3Q68CR1 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SEL1L3Q68CR1 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEL1L3Q68CR1 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEL1L3Q68CR1 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEL1L3Q68CR1 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEL1L3Q68CR1 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEL1L3Q68CR1 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SEL1L3Q68CR1 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SEL1L3Q68CR1 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SEL1L3Q68CR1 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SEL1L3Q68CR1 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
SEL1L3Q68CR1 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SEL1L3Q68CR1 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEL1L3Q68CR1 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEL1L3Q68CR1 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEL1L3Q68CR1 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SEL1L3Q68CR1 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEL1L3Q68CR1 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEL1L3Q68CR1 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEL1L3Q68CR1 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEL1L3Q68CR1 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEL1L3Q68CR1 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEL1L3Q68CR1 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEL1L3Q68CR1 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEL1L3Q68CR1 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEL1L3Q68CR1 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEL1L3Q68CR1 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEL1L3Q68CR1 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEL1L3Q68CR1 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEL1L3Q68CR1 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEL1L3Q68CR1 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEL1L3Q68CR1 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEL1L3Q68CR1 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEL1L3Q68CR1 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEL1L3Q68CR1 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEL1L3Q68CR1 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEL1L3Q68CR1 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEL1L3Q68CR1 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEL1L3Q68CR1 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEL1L3Q68CR1 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEL1L3Q68CR1 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEL1L3Q68CR1 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEL1L3Q68CR1 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEL1L3Q68CR1 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms