Protein–RNA interactions for Protein: Q63HK3

ZKSCAN2, Zinc finger protein with KRAB and SCAN domains 2, humanhuman

Predictions only

Length 967 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZKSCAN2Q63HK3 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ZKSCAN2Q63HK3 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ZKSCAN2Q63HK3 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ZKSCAN2Q63HK3 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ZKSCAN2Q63HK3 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ZKSCAN2Q63HK3 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ZKSCAN2Q63HK3 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ZKSCAN2Q63HK3 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ZKSCAN2Q63HK3 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ZKSCAN2Q63HK3 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ZKSCAN2Q63HK3 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ZKSCAN2Q63HK3 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ZKSCAN2Q63HK3 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ZKSCAN2Q63HK3 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ZKSCAN2Q63HK3 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
ZKSCAN2Q63HK3 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZKSCAN2Q63HK3 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZKSCAN2Q63HK3 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZKSCAN2Q63HK3 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
ZKSCAN2Q63HK3 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZKSCAN2Q63HK3 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZKSCAN2Q63HK3 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZKSCAN2Q63HK3 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZKSCAN2Q63HK3 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZKSCAN2Q63HK3 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZKSCAN2Q63HK3 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZKSCAN2Q63HK3 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZKSCAN2Q63HK3 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZKSCAN2Q63HK3 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZKSCAN2Q63HK3 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZKSCAN2Q63HK3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZKSCAN2Q63HK3 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZKSCAN2Q63HK3 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZKSCAN2Q63HK3 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZKSCAN2Q63HK3 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ZKSCAN2Q63HK3 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ZKSCAN2Q63HK3 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ZKSCAN2Q63HK3 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
ZKSCAN2Q63HK3 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ZKSCAN2Q63HK3 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ZKSCAN2Q63HK3 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ZKSCAN2Q63HK3 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ZKSCAN2Q63HK3 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ZKSCAN2Q63HK3 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ZKSCAN2Q63HK3 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ZKSCAN2Q63HK3 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ZKSCAN2Q63HK3 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ZKSCAN2Q63HK3 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ZKSCAN2Q63HK3 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ZKSCAN2Q63HK3 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ZKSCAN2Q63HK3 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ZKSCAN2Q63HK3 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ZKSCAN2Q63HK3 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ZKSCAN2Q63HK3 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ZKSCAN2Q63HK3 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ZKSCAN2Q63HK3 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ZKSCAN2Q63HK3 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ZKSCAN2Q63HK3 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ZKSCAN2Q63HK3 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ZKSCAN2Q63HK3 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ZKSCAN2Q63HK3 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ZKSCAN2Q63HK3 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ZKSCAN2Q63HK3 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ZKSCAN2Q63HK3 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ZKSCAN2Q63HK3 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ZKSCAN2Q63HK3 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ZKSCAN2Q63HK3 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ZKSCAN2Q63HK3 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ZKSCAN2Q63HK3 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ZKSCAN2Q63HK3 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ZKSCAN2Q63HK3 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ZKSCAN2Q63HK3 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ZKSCAN2Q63HK3 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
ZKSCAN2Q63HK3 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ZKSCAN2Q63HK3 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ZKSCAN2Q63HK3 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ZKSCAN2Q63HK3 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ZKSCAN2Q63HK3 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ZKSCAN2Q63HK3 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
ZKSCAN2Q63HK3 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.04
ZKSCAN2Q63HK3 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ZKSCAN2Q63HK3 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ZKSCAN2Q63HK3 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
ZKSCAN2Q63HK3 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ZKSCAN2Q63HK3 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ZKSCAN2Q63HK3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ZKSCAN2Q63HK3 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ZKSCAN2Q63HK3 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ZKSCAN2Q63HK3 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ZKSCAN2Q63HK3 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ZKSCAN2Q63HK3 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ZKSCAN2Q63HK3 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ZKSCAN2Q63HK3 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ZKSCAN2Q63HK3 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ZKSCAN2Q63HK3 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ZKSCAN2Q63HK3 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ZKSCAN2Q63HK3 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ZKSCAN2Q63HK3 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ZKSCAN2Q63HK3 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ZKSCAN2Q63HK3 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms