Protein–RNA interactions for Protein: Q60I27

ALS2CL, ALS2 C-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CLQ60I27 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ALS2CLQ60I27 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ALS2CLQ60I27 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ALS2CLQ60I27 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ALS2CLQ60I27 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ALS2CLQ60I27 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ALS2CLQ60I27 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ALS2CLQ60I27 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ALS2CLQ60I27 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ALS2CLQ60I27 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
ALS2CLQ60I27 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ALS2CLQ60I27 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ALS2CLQ60I27 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ALS2CLQ60I27 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ALS2CLQ60I27 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ALS2CLQ60I27 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ALS2CLQ60I27 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ALS2CLQ60I27 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ALS2CLQ60I27 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ALS2CLQ60I27 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ALS2CLQ60I27 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ALS2CLQ60I27 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ALS2CLQ60I27 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ALS2CLQ60I27 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ALS2CLQ60I27 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ALS2CLQ60I27 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ALS2CLQ60I27 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ALS2CLQ60I27 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ALS2CLQ60I27 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ALS2CLQ60I27 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ALS2CLQ60I27 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ALS2CLQ60I27 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ALS2CLQ60I27 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ALS2CLQ60I27 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ALS2CLQ60I27 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ALS2CLQ60I27 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ALS2CLQ60I27 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ALS2CLQ60I27 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ALS2CLQ60I27 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ALS2CLQ60I27 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ALS2CLQ60I27 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ALS2CLQ60I27 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ALS2CLQ60I27 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ALS2CLQ60I27 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ALS2CLQ60I27 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ALS2CLQ60I27 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ALS2CLQ60I27 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ALS2CLQ60I27 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ALS2CLQ60I27 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ALS2CLQ60I27 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ALS2CLQ60I27 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ALS2CLQ60I27 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ALS2CLQ60I27 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ALS2CLQ60I27 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ALS2CLQ60I27 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ALS2CLQ60I27 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ALS2CLQ60I27 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ALS2CLQ60I27 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ALS2CLQ60I27 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ALS2CLQ60I27 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ALS2CLQ60I27 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ALS2CLQ60I27 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ALS2CLQ60I27 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ALS2CLQ60I27 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ALS2CLQ60I27 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ALS2CLQ60I27 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ALS2CLQ60I27 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ALS2CLQ60I27 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ALS2CLQ60I27 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ALS2CLQ60I27 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ALS2CLQ60I27 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ALS2CLQ60I27 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ALS2CLQ60I27 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ALS2CLQ60I27 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ALS2CLQ60I27 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ALS2CLQ60I27 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ALS2CLQ60I27 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ALS2CLQ60I27 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ALS2CLQ60I27 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ALS2CLQ60I27 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ALS2CLQ60I27 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ALS2CLQ60I27 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ALS2CLQ60I27 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ALS2CLQ60I27 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ALS2CLQ60I27 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ALS2CLQ60I27 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ALS2CLQ60I27 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ALS2CLQ60I27 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ALS2CLQ60I27 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ALS2CLQ60I27 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ALS2CLQ60I27 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ALS2CLQ60I27 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ALS2CLQ60I27 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ALS2CLQ60I27 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
ALS2CLQ60I27 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
ALS2CLQ60I27 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ALS2CLQ60I27 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ALS2CLQ60I27 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ALS2CLQ60I27 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ALS2CLQ60I27 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms