Protein–RNA interactions for Protein: Q5VV11

Putative UPF0633 protein ENSP00000303136, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q5VV11 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q5VV11 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q5VV11 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Q5VV11 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Q5VV11 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Q5VV11 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Q5VV11 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Q5VV11 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q5VV11 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q5VV11 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q5VV11 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q5VV11 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q5VV11 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q5VV11 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q5VV11 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q5VV11 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q5VV11 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q5VV11 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q5VV11 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q5VV11 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q5VV11 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q5VV11 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q5VV11 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q5VV11 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q5VV11 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q5VV11 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q5VV11 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q5VV11 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q5VV11 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q5VV11 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q5VV11 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q5VV11 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q5VV11 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q5VV11 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q5VV11 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q5VV11 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q5VV11 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q5VV11 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q5VV11 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q5VV11 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q5VV11 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Q5VV11 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q5VV11 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q5VV11 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q5VV11 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q5VV11 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q5VV11 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q5VV11 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q5VV11 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q5VV11 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q5VV11 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q5VV11 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q5VV11 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q5VV11 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q5VV11 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q5VV11 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q5VV11 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q5VV11 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q5VV11 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q5VV11 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q5VV11 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q5VV11 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q5VV11 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q5VV11 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q5VV11 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q5VV11 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q5VV11 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q5VV11 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q5VV11 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q5VV11 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q5VV11 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q5VV11 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q5VV11 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q5VV11 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q5VV11 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q5VV11 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q5VV11 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q5VV11 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q5VV11 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q5VV11 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q5VV11 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q5VV11 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q5VV11 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q5VV11 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q5VV11 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q5VV11 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q5VV11 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q5VV11 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q5VV11 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q5VV11 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q5VV11 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q5VV11 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q5VV11 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q5VV11 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q5VV11 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q5VV11 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q5VV11 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q5VV11 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q5VV11 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q5VV11 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms