Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
C9orf135Q5VTT2 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
C9orf135Q5VTT2 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
C9orf135Q5VTT2 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
C9orf135Q5VTT2 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
C9orf135Q5VTT2 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
C9orf135Q5VTT2 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
C9orf135Q5VTT2 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
C9orf135Q5VTT2 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
C9orf135Q5VTT2 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
C9orf135Q5VTT2 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
C9orf135Q5VTT2 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
C9orf135Q5VTT2 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
C9orf135Q5VTT2 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
C9orf135Q5VTT2 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
C9orf135Q5VTT2 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
C9orf135Q5VTT2 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
C9orf135Q5VTT2 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
C9orf135Q5VTT2 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
C9orf135Q5VTT2 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
C9orf135Q5VTT2 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
C9orf135Q5VTT2 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
C9orf135Q5VTT2 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
C9orf135Q5VTT2 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
C9orf135Q5VTT2 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
C9orf135Q5VTT2 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
C9orf135Q5VTT2 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
C9orf135Q5VTT2 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
C9orf135Q5VTT2 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
C9orf135Q5VTT2 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
C9orf135Q5VTT2 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
C9orf135Q5VTT2 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
C9orf135Q5VTT2 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
C9orf135Q5VTT2 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
C9orf135Q5VTT2 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
C9orf135Q5VTT2 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
C9orf135Q5VTT2 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
C9orf135Q5VTT2 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
C9orf135Q5VTT2 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
C9orf135Q5VTT2 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
C9orf135Q5VTT2 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
C9orf135Q5VTT2 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
C9orf135Q5VTT2 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
C9orf135Q5VTT2 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
C9orf135Q5VTT2 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
C9orf135Q5VTT2 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
C9orf135Q5VTT2 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
C9orf135Q5VTT2 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
C9orf135Q5VTT2 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
C9orf135Q5VTT2 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
C9orf135Q5VTT2 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
C9orf135Q5VTT2 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
C9orf135Q5VTT2 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
C9orf135Q5VTT2 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
C9orf135Q5VTT2 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
C9orf135Q5VTT2 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
C9orf135Q5VTT2 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
C9orf135Q5VTT2 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
C9orf135Q5VTT2 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
C9orf135Q5VTT2 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
C9orf135Q5VTT2 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
C9orf135Q5VTT2 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
C9orf135Q5VTT2 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
C9orf135Q5VTT2 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
C9orf135Q5VTT2 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
C9orf135Q5VTT2 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
C9orf135Q5VTT2 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
C9orf135Q5VTT2 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
C9orf135Q5VTT2 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
C9orf135Q5VTT2 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
C9orf135Q5VTT2 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
C9orf135Q5VTT2 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
C9orf135Q5VTT2 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
C9orf135Q5VTT2 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
C9orf135Q5VTT2 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
C9orf135Q5VTT2 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
C9orf135Q5VTT2 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
C9orf135Q5VTT2 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
C9orf135Q5VTT2 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
C9orf135Q5VTT2 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
C9orf135Q5VTT2 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
C9orf135Q5VTT2 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
C9orf135Q5VTT2 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
C9orf135Q5VTT2 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
C9orf135Q5VTT2 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
C9orf135Q5VTT2 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
C9orf135Q5VTT2 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
C9orf135Q5VTT2 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
C9orf135Q5VTT2 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
C9orf135Q5VTT2 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
C9orf135Q5VTT2 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
C9orf135Q5VTT2 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
C9orf135Q5VTT2 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
C9orf135Q5VTT2 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
C9orf135Q5VTT2 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
C9orf135Q5VTT2 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
C9orf135Q5VTT2 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
C9orf135Q5VTT2 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
C9orf135Q5VTT2 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
C9orf135Q5VTT2 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms