Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT99

LRRC38, Leucine-rich repeat-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC38Q5VT99 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC38Q5VT99 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC38Q5VT99 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC38Q5VT99 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC38Q5VT99 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC38Q5VT99 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC38Q5VT99 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC38Q5VT99 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC38Q5VT99 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC38Q5VT99 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC38Q5VT99 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC38Q5VT99 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC38Q5VT99 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC38Q5VT99 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC38Q5VT99 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC38Q5VT99 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC38Q5VT99 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC38Q5VT99 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC38Q5VT99 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC38Q5VT99 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC38Q5VT99 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC38Q5VT99 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC38Q5VT99 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC38Q5VT99 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC38Q5VT99 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC38Q5VT99 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC38Q5VT99 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC38Q5VT99 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC38Q5VT99 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC38Q5VT99 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC38Q5VT99 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC38Q5VT99 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC38Q5VT99 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC38Q5VT99 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC38Q5VT99 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC38Q5VT99 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC38Q5VT99 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC38Q5VT99 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC38Q5VT99 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC38Q5VT99 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC38Q5VT99 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC38Q5VT99 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC38Q5VT99 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC38Q5VT99 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC38Q5VT99 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC38Q5VT99 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC38Q5VT99 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC38Q5VT99 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC38Q5VT99 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC38Q5VT99 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC38Q5VT99 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC38Q5VT99 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC38Q5VT99 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC38Q5VT99 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC38Q5VT99 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC38Q5VT99 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC38Q5VT99 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC38Q5VT99 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC38Q5VT99 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC38Q5VT99 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC38Q5VT99 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC38Q5VT99 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC38Q5VT99 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC38Q5VT99 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC38Q5VT99 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC38Q5VT99 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC38Q5VT99 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC38Q5VT99 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC38Q5VT99 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC38Q5VT99 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC38Q5VT99 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC38Q5VT99 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC38Q5VT99 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC38Q5VT99 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC38Q5VT99 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC38Q5VT99 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC38Q5VT99 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC38Q5VT99 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC38Q5VT99 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC38Q5VT99 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC38Q5VT99 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC38Q5VT99 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC38Q5VT99 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC38Q5VT99 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC38Q5VT99 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRC38Q5VT99 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRC38Q5VT99 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRC38Q5VT99 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRC38Q5VT99 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRC38Q5VT99 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRC38Q5VT99 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRC38Q5VT99 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRC38Q5VT99 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRC38Q5VT99 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRC38Q5VT99 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRC38Q5VT99 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRC38Q5VT99 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRC38Q5VT99 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRC38Q5VT99 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRC38Q5VT99 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms