Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGL8

PXDC1, PX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXDC1Q5TGL8 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PXDC1Q5TGL8 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PXDC1Q5TGL8 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PXDC1Q5TGL8 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PXDC1Q5TGL8 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PXDC1Q5TGL8 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PXDC1Q5TGL8 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PXDC1Q5TGL8 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PXDC1Q5TGL8 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PXDC1Q5TGL8 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PXDC1Q5TGL8 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PXDC1Q5TGL8 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PXDC1Q5TGL8 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PXDC1Q5TGL8 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PXDC1Q5TGL8 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PXDC1Q5TGL8 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PXDC1Q5TGL8 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PXDC1Q5TGL8 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PXDC1Q5TGL8 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PXDC1Q5TGL8 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PXDC1Q5TGL8 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PXDC1Q5TGL8 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PXDC1Q5TGL8 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PXDC1Q5TGL8 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PXDC1Q5TGL8 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PXDC1Q5TGL8 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PXDC1Q5TGL8 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PXDC1Q5TGL8 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PXDC1Q5TGL8 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PXDC1Q5TGL8 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PXDC1Q5TGL8 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PXDC1Q5TGL8 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PXDC1Q5TGL8 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PXDC1Q5TGL8 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PXDC1Q5TGL8 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PXDC1Q5TGL8 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PXDC1Q5TGL8 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PXDC1Q5TGL8 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PXDC1Q5TGL8 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PXDC1Q5TGL8 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PXDC1Q5TGL8 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PXDC1Q5TGL8 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PXDC1Q5TGL8 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PXDC1Q5TGL8 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PXDC1Q5TGL8 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PXDC1Q5TGL8 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PXDC1Q5TGL8 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PXDC1Q5TGL8 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PXDC1Q5TGL8 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PXDC1Q5TGL8 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PXDC1Q5TGL8 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PXDC1Q5TGL8 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PXDC1Q5TGL8 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PXDC1Q5TGL8 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PXDC1Q5TGL8 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PXDC1Q5TGL8 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PXDC1Q5TGL8 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PXDC1Q5TGL8 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PXDC1Q5TGL8 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PXDC1Q5TGL8 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PXDC1Q5TGL8 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PXDC1Q5TGL8 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PXDC1Q5TGL8 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PXDC1Q5TGL8 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PXDC1Q5TGL8 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PXDC1Q5TGL8 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PXDC1Q5TGL8 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PXDC1Q5TGL8 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PXDC1Q5TGL8 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PXDC1Q5TGL8 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PXDC1Q5TGL8 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PXDC1Q5TGL8 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PXDC1Q5TGL8 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PXDC1Q5TGL8 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PXDC1Q5TGL8 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PXDC1Q5TGL8 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PXDC1Q5TGL8 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PXDC1Q5TGL8 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PXDC1Q5TGL8 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PXDC1Q5TGL8 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PXDC1Q5TGL8 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PXDC1Q5TGL8 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PXDC1Q5TGL8 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PXDC1Q5TGL8 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PXDC1Q5TGL8 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PXDC1Q5TGL8 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PXDC1Q5TGL8 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PXDC1Q5TGL8 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PXDC1Q5TGL8 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PXDC1Q5TGL8 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PXDC1Q5TGL8 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PXDC1Q5TGL8 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PXDC1Q5TGL8 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PXDC1Q5TGL8 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PXDC1Q5TGL8 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PXDC1Q5TGL8 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PXDC1Q5TGL8 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PXDC1Q5TGL8 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PXDC1Q5TGL8 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PXDC1Q5TGL8 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms