Protein–RNA interactions for Protein: Q5T7P6

TMEM78, Transmembrane protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM78Q5T7P6 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM78Q5T7P6 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM78Q5T7P6 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM78Q5T7P6 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM78Q5T7P6 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM78Q5T7P6 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM78Q5T7P6 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM78Q5T7P6 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM78Q5T7P6 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM78Q5T7P6 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM78Q5T7P6 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM78Q5T7P6 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM78Q5T7P6 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM78Q5T7P6 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM78Q5T7P6 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM78Q5T7P6 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM78Q5T7P6 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM78Q5T7P6 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM78Q5T7P6 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM78Q5T7P6 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM78Q5T7P6 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM78Q5T7P6 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM78Q5T7P6 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM78Q5T7P6 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM78Q5T7P6 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM78Q5T7P6 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM78Q5T7P6 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM78Q5T7P6 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM78Q5T7P6 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM78Q5T7P6 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM78Q5T7P6 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM78Q5T7P6 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM78Q5T7P6 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM78Q5T7P6 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM78Q5T7P6 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM78Q5T7P6 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM78Q5T7P6 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM78Q5T7P6 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM78Q5T7P6 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM78Q5T7P6 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM78Q5T7P6 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM78Q5T7P6 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM78Q5T7P6 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM78Q5T7P6 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM78Q5T7P6 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM78Q5T7P6 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM78Q5T7P6 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM78Q5T7P6 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM78Q5T7P6 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM78Q5T7P6 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM78Q5T7P6 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM78Q5T7P6 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TMEM78Q5T7P6 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TMEM78Q5T7P6 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TMEM78Q5T7P6 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TMEM78Q5T7P6 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM78Q5T7P6 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM78Q5T7P6 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM78Q5T7P6 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM78Q5T7P6 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM78Q5T7P6 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM78Q5T7P6 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM78Q5T7P6 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM78Q5T7P6 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM78Q5T7P6 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM78Q5T7P6 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM78Q5T7P6 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM78Q5T7P6 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM78Q5T7P6 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM78Q5T7P6 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM78Q5T7P6 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM78Q5T7P6 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM78Q5T7P6 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM78Q5T7P6 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM78Q5T7P6 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM78Q5T7P6 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM78Q5T7P6 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM78Q5T7P6 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM78Q5T7P6 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM78Q5T7P6 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM78Q5T7P6 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM78Q5T7P6 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM78Q5T7P6 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM78Q5T7P6 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM78Q5T7P6 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM78Q5T7P6 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM78Q5T7P6 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM78Q5T7P6 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM78Q5T7P6 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM78Q5T7P6 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM78Q5T7P6 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM78Q5T7P6 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM78Q5T7P6 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM78Q5T7P6 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM78Q5T7P6 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM78Q5T7P6 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM78Q5T7P6 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM78Q5T7P6 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM78Q5T7P6 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM78Q5T7P6 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms