Protein–RNA interactions for Protein: Q5T619

ZNF648, Zinc finger protein 648, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF648Q5T619 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF648Q5T619 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF648Q5T619 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF648Q5T619 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF648Q5T619 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF648Q5T619 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF648Q5T619 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF648Q5T619 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF648Q5T619 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF648Q5T619 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF648Q5T619 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF648Q5T619 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF648Q5T619 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF648Q5T619 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF648Q5T619 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF648Q5T619 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF648Q5T619 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF648Q5T619 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF648Q5T619 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF648Q5T619 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF648Q5T619 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF648Q5T619 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF648Q5T619 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF648Q5T619 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF648Q5T619 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF648Q5T619 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF648Q5T619 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF648Q5T619 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF648Q5T619 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF648Q5T619 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF648Q5T619 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF648Q5T619 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF648Q5T619 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF648Q5T619 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF648Q5T619 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF648Q5T619 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF648Q5T619 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF648Q5T619 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF648Q5T619 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF648Q5T619 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF648Q5T619 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF648Q5T619 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF648Q5T619 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF648Q5T619 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF648Q5T619 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF648Q5T619 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF648Q5T619 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF648Q5T619 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF648Q5T619 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF648Q5T619 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF648Q5T619 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF648Q5T619 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF648Q5T619 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF648Q5T619 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF648Q5T619 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF648Q5T619 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF648Q5T619 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF648Q5T619 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF648Q5T619 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF648Q5T619 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF648Q5T619 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF648Q5T619 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF648Q5T619 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF648Q5T619 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF648Q5T619 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF648Q5T619 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF648Q5T619 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNF648Q5T619 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNF648Q5T619 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNF648Q5T619 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNF648Q5T619 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNF648Q5T619 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNF648Q5T619 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNF648Q5T619 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNF648Q5T619 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ZNF648Q5T619 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ZNF648Q5T619 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ZNF648Q5T619 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ZNF648Q5T619 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ZNF648Q5T619 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF648Q5T619 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF648Q5T619 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF648Q5T619 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF648Q5T619 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF648Q5T619 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF648Q5T619 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF648Q5T619 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF648Q5T619 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF648Q5T619 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF648Q5T619 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF648Q5T619 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF648Q5T619 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF648Q5T619 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF648Q5T619 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF648Q5T619 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF648Q5T619 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF648Q5T619 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF648Q5T619 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF648Q5T619 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF648Q5T619 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms