Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0J3

C1orf220, Putative uncharacterized protein C1orf220, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf220Q5T0J3 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
C1orf220Q5T0J3 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
C1orf220Q5T0J3 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
C1orf220Q5T0J3 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
C1orf220Q5T0J3 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
C1orf220Q5T0J3 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
C1orf220Q5T0J3 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
C1orf220Q5T0J3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
C1orf220Q5T0J3 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
C1orf220Q5T0J3 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
C1orf220Q5T0J3 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
C1orf220Q5T0J3 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
C1orf220Q5T0J3 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
C1orf220Q5T0J3 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
C1orf220Q5T0J3 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
C1orf220Q5T0J3 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
C1orf220Q5T0J3 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
C1orf220Q5T0J3 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
C1orf220Q5T0J3 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
C1orf220Q5T0J3 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
C1orf220Q5T0J3 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
C1orf220Q5T0J3 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
C1orf220Q5T0J3 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
C1orf220Q5T0J3 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
C1orf220Q5T0J3 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
C1orf220Q5T0J3 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
C1orf220Q5T0J3 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
C1orf220Q5T0J3 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
C1orf220Q5T0J3 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
C1orf220Q5T0J3 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
C1orf220Q5T0J3 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
C1orf220Q5T0J3 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
C1orf220Q5T0J3 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
C1orf220Q5T0J3 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
C1orf220Q5T0J3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
C1orf220Q5T0J3 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
C1orf220Q5T0J3 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
C1orf220Q5T0J3 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
C1orf220Q5T0J3 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
C1orf220Q5T0J3 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
C1orf220Q5T0J3 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
C1orf220Q5T0J3 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
C1orf220Q5T0J3 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
C1orf220Q5T0J3 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C1orf220Q5T0J3 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C1orf220Q5T0J3 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
C1orf220Q5T0J3 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
C1orf220Q5T0J3 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
C1orf220Q5T0J3 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
C1orf220Q5T0J3 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
C1orf220Q5T0J3 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
C1orf220Q5T0J3 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
C1orf220Q5T0J3 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C1orf220Q5T0J3 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C1orf220Q5T0J3 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
C1orf220Q5T0J3 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
C1orf220Q5T0J3 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
C1orf220Q5T0J3 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
C1orf220Q5T0J3 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
C1orf220Q5T0J3 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
C1orf220Q5T0J3 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
C1orf220Q5T0J3 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
C1orf220Q5T0J3 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
C1orf220Q5T0J3 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
C1orf220Q5T0J3 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
C1orf220Q5T0J3 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C1orf220Q5T0J3 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
C1orf220Q5T0J3 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
C1orf220Q5T0J3 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
C1orf220Q5T0J3 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
C1orf220Q5T0J3 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C1orf220Q5T0J3 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
C1orf220Q5T0J3 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C1orf220Q5T0J3 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
C1orf220Q5T0J3 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
C1orf220Q5T0J3 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C1orf220Q5T0J3 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
C1orf220Q5T0J3 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C1orf220Q5T0J3 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C1orf220Q5T0J3 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
C1orf220Q5T0J3 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C1orf220Q5T0J3 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C1orf220Q5T0J3 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C1orf220Q5T0J3 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
C1orf220Q5T0J3 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C1orf220Q5T0J3 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C1orf220Q5T0J3 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
C1orf220Q5T0J3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
C1orf220Q5T0J3 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
C1orf220Q5T0J3 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C1orf220Q5T0J3 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
C1orf220Q5T0J3 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
C1orf220Q5T0J3 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
C1orf220Q5T0J3 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
C1orf220Q5T0J3 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C1orf220Q5T0J3 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C1orf220Q5T0J3 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
C1orf220Q5T0J3 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
C1orf220Q5T0J3 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
C1orf220Q5T0J3 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms