Protein–RNA interactions for Protein: Q5SQQ9

VAX1, Ventral anterior homeobox 1, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAX1Q5SQQ9 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
VAX1Q5SQQ9 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VAX1Q5SQQ9 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
VAX1Q5SQQ9 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
VAX1Q5SQQ9 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
VAX1Q5SQQ9 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VAX1Q5SQQ9 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VAX1Q5SQQ9 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
VAX1Q5SQQ9 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VAX1Q5SQQ9 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VAX1Q5SQQ9 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
VAX1Q5SQQ9 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VAX1Q5SQQ9 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VAX1Q5SQQ9 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VAX1Q5SQQ9 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
VAX1Q5SQQ9 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
VAX1Q5SQQ9 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
VAX1Q5SQQ9 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
VAX1Q5SQQ9 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
VAX1Q5SQQ9 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
VAX1Q5SQQ9 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
VAX1Q5SQQ9 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VAX1Q5SQQ9 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
VAX1Q5SQQ9 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VAX1Q5SQQ9 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VAX1Q5SQQ9 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VAX1Q5SQQ9 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VAX1Q5SQQ9 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
VAX1Q5SQQ9 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
VAX1Q5SQQ9 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
VAX1Q5SQQ9 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
VAX1Q5SQQ9 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VAX1Q5SQQ9 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VAX1Q5SQQ9 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VAX1Q5SQQ9 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
VAX1Q5SQQ9 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VAX1Q5SQQ9 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
VAX1Q5SQQ9 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
VAX1Q5SQQ9 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VAX1Q5SQQ9 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
VAX1Q5SQQ9 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VAX1Q5SQQ9 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VAX1Q5SQQ9 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VAX1Q5SQQ9 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VAX1Q5SQQ9 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VAX1Q5SQQ9 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VAX1Q5SQQ9 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VAX1Q5SQQ9 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VAX1Q5SQQ9 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VAX1Q5SQQ9 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VAX1Q5SQQ9 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VAX1Q5SQQ9 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VAX1Q5SQQ9 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VAX1Q5SQQ9 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VAX1Q5SQQ9 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VAX1Q5SQQ9 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VAX1Q5SQQ9 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VAX1Q5SQQ9 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VAX1Q5SQQ9 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VAX1Q5SQQ9 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VAX1Q5SQQ9 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VAX1Q5SQQ9 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VAX1Q5SQQ9 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VAX1Q5SQQ9 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VAX1Q5SQQ9 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VAX1Q5SQQ9 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VAX1Q5SQQ9 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VAX1Q5SQQ9 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
VAX1Q5SQQ9 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VAX1Q5SQQ9 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VAX1Q5SQQ9 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VAX1Q5SQQ9 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VAX1Q5SQQ9 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VAX1Q5SQQ9 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VAX1Q5SQQ9 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VAX1Q5SQQ9 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VAX1Q5SQQ9 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VAX1Q5SQQ9 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VAX1Q5SQQ9 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VAX1Q5SQQ9 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VAX1Q5SQQ9 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
VAX1Q5SQQ9 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VAX1Q5SQQ9 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VAX1Q5SQQ9 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VAX1Q5SQQ9 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VAX1Q5SQQ9 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VAX1Q5SQQ9 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VAX1Q5SQQ9 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VAX1Q5SQQ9 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VAX1Q5SQQ9 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VAX1Q5SQQ9 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VAX1Q5SQQ9 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VAX1Q5SQQ9 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VAX1Q5SQQ9 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VAX1Q5SQQ9 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VAX1Q5SQQ9 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VAX1Q5SQQ9 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VAX1Q5SQQ9 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VAX1Q5SQQ9 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VAX1Q5SQQ9 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.7 ms