Protein–RNA interactions for Protein: Q5K4L6

SLC27A3, Long-chain fatty acid transport protein 3, humanhuman

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Length 730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A3Q5K4L6 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
SLC27A3Q5K4L6 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SLC27A3Q5K4L6 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SLC27A3Q5K4L6 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SLC27A3Q5K4L6 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SLC27A3Q5K4L6 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SLC27A3Q5K4L6 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SLC27A3Q5K4L6 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SLC27A3Q5K4L6 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SLC27A3Q5K4L6 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SLC27A3Q5K4L6 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SLC27A3Q5K4L6 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SLC27A3Q5K4L6 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SLC27A3Q5K4L6 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SLC27A3Q5K4L6 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SLC27A3Q5K4L6 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
SLC27A3Q5K4L6 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
SLC27A3Q5K4L6 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SLC27A3Q5K4L6 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SLC27A3Q5K4L6 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SLC27A3Q5K4L6 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SLC27A3Q5K4L6 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SLC27A3Q5K4L6 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SLC27A3Q5K4L6 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SLC27A3Q5K4L6 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
SLC27A3Q5K4L6 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SLC27A3Q5K4L6 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SLC27A3Q5K4L6 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SLC27A3Q5K4L6 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SLC27A3Q5K4L6 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
SLC27A3Q5K4L6 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SLC27A3Q5K4L6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SLC27A3Q5K4L6 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SLC27A3Q5K4L6 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SLC27A3Q5K4L6 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SLC27A3Q5K4L6 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SLC27A3Q5K4L6 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SLC27A3Q5K4L6 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SLC27A3Q5K4L6 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SLC27A3Q5K4L6 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SLC27A3Q5K4L6 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SLC27A3Q5K4L6 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
SLC27A3Q5K4L6 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SLC27A3Q5K4L6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SLC27A3Q5K4L6 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLC27A3Q5K4L6 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLC27A3Q5K4L6 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLC27A3Q5K4L6 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLC27A3Q5K4L6 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLC27A3Q5K4L6 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SLC27A3Q5K4L6 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SLC27A3Q5K4L6 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SLC27A3Q5K4L6 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SLC27A3Q5K4L6 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SLC27A3Q5K4L6 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SLC27A3Q5K4L6 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLC27A3Q5K4L6 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLC27A3Q5K4L6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLC27A3Q5K4L6 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLC27A3Q5K4L6 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SLC27A3Q5K4L6 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SLC27A3Q5K4L6 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SLC27A3Q5K4L6 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SLC27A3Q5K4L6 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SLC27A3Q5K4L6 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SLC27A3Q5K4L6 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SLC27A3Q5K4L6 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLC27A3Q5K4L6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLC27A3Q5K4L6 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLC27A3Q5K4L6 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLC27A3Q5K4L6 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLC27A3Q5K4L6 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLC27A3Q5K4L6 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLC27A3Q5K4L6 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLC27A3Q5K4L6 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
SLC27A3Q5K4L6 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLC27A3Q5K4L6 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLC27A3Q5K4L6 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLC27A3Q5K4L6 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SLC27A3Q5K4L6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SLC27A3Q5K4L6 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SLC27A3Q5K4L6 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
SLC27A3Q5K4L6 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SLC27A3Q5K4L6 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SLC27A3Q5K4L6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLC27A3Q5K4L6 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLC27A3Q5K4L6 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLC27A3Q5K4L6 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLC27A3Q5K4L6 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLC27A3Q5K4L6 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLC27A3Q5K4L6 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SLC27A3Q5K4L6 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SLC27A3Q5K4L6 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SLC27A3Q5K4L6 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SLC27A3Q5K4L6 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SLC27A3Q5K4L6 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SLC27A3Q5K4L6 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SLC27A3Q5K4L6 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC28■■■□□ 2.07
SLC27A3Q5K4L6 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SLC27A3Q5K4L6 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
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