Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVF3

PCID2, PCI domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCID2Q5JVF3 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCID2Q5JVF3 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCID2Q5JVF3 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCID2Q5JVF3 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCID2Q5JVF3 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCID2Q5JVF3 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCID2Q5JVF3 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCID2Q5JVF3 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCID2Q5JVF3 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCID2Q5JVF3 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCID2Q5JVF3 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCID2Q5JVF3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCID2Q5JVF3 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCID2Q5JVF3 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCID2Q5JVF3 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCID2Q5JVF3 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PCID2Q5JVF3 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PCID2Q5JVF3 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCID2Q5JVF3 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCID2Q5JVF3 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCID2Q5JVF3 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCID2Q5JVF3 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCID2Q5JVF3 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCID2Q5JVF3 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCID2Q5JVF3 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCID2Q5JVF3 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCID2Q5JVF3 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCID2Q5JVF3 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCID2Q5JVF3 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCID2Q5JVF3 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCID2Q5JVF3 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCID2Q5JVF3 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCID2Q5JVF3 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCID2Q5JVF3 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCID2Q5JVF3 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCID2Q5JVF3 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCID2Q5JVF3 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCID2Q5JVF3 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCID2Q5JVF3 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCID2Q5JVF3 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCID2Q5JVF3 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCID2Q5JVF3 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
PCID2Q5JVF3 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
PCID2Q5JVF3 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
PCID2Q5JVF3 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCID2Q5JVF3 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCID2Q5JVF3 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCID2Q5JVF3 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCID2Q5JVF3 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCID2Q5JVF3 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCID2Q5JVF3 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCID2Q5JVF3 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCID2Q5JVF3 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCID2Q5JVF3 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCID2Q5JVF3 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCID2Q5JVF3 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCID2Q5JVF3 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCID2Q5JVF3 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCID2Q5JVF3 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCID2Q5JVF3 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCID2Q5JVF3 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCID2Q5JVF3 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCID2Q5JVF3 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCID2Q5JVF3 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCID2Q5JVF3 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCID2Q5JVF3 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PCID2Q5JVF3 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PCID2Q5JVF3 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PCID2Q5JVF3 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PCID2Q5JVF3 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PCID2Q5JVF3 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PCID2Q5JVF3 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PCID2Q5JVF3 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PCID2Q5JVF3 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PCID2Q5JVF3 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PCID2Q5JVF3 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PCID2Q5JVF3 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PCID2Q5JVF3 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PCID2Q5JVF3 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PCID2Q5JVF3 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PCID2Q5JVF3 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PCID2Q5JVF3 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PCID2Q5JVF3 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PCID2Q5JVF3 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PCID2Q5JVF3 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PCID2Q5JVF3 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PCID2Q5JVF3 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PCID2Q5JVF3 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PCID2Q5JVF3 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PCID2Q5JVF3 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PCID2Q5JVF3 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PCID2Q5JVF3 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PCID2Q5JVF3 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PCID2Q5JVF3 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PCID2Q5JVF3 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PCID2Q5JVF3 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PCID2Q5JVF3 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PCID2Q5JVF3 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PCID2Q5JVF3 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PCID2Q5JVF3 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms