Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSH3

WDR44, WD repeat-containing protein 44, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR44Q5JSH3 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
WDR44Q5JSH3 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
WDR44Q5JSH3 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
WDR44Q5JSH3 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
WDR44Q5JSH3 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
WDR44Q5JSH3 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
WDR44Q5JSH3 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
WDR44Q5JSH3 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
WDR44Q5JSH3 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
WDR44Q5JSH3 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
WDR44Q5JSH3 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
WDR44Q5JSH3 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
WDR44Q5JSH3 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
WDR44Q5JSH3 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
WDR44Q5JSH3 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
WDR44Q5JSH3 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
WDR44Q5JSH3 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
WDR44Q5JSH3 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
WDR44Q5JSH3 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
WDR44Q5JSH3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
WDR44Q5JSH3 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
WDR44Q5JSH3 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
WDR44Q5JSH3 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
WDR44Q5JSH3 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
WDR44Q5JSH3 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
WDR44Q5JSH3 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
WDR44Q5JSH3 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
WDR44Q5JSH3 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
WDR44Q5JSH3 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
WDR44Q5JSH3 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
WDR44Q5JSH3 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
WDR44Q5JSH3 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
WDR44Q5JSH3 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
WDR44Q5JSH3 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
WDR44Q5JSH3 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
WDR44Q5JSH3 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
WDR44Q5JSH3 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
WDR44Q5JSH3 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
WDR44Q5JSH3 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
WDR44Q5JSH3 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
WDR44Q5JSH3 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
WDR44Q5JSH3 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
WDR44Q5JSH3 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
WDR44Q5JSH3 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
WDR44Q5JSH3 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
WDR44Q5JSH3 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
WDR44Q5JSH3 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
WDR44Q5JSH3 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
WDR44Q5JSH3 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
WDR44Q5JSH3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
WDR44Q5JSH3 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
WDR44Q5JSH3 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
WDR44Q5JSH3 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
WDR44Q5JSH3 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
WDR44Q5JSH3 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
WDR44Q5JSH3 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
WDR44Q5JSH3 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
WDR44Q5JSH3 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
WDR44Q5JSH3 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
WDR44Q5JSH3 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
WDR44Q5JSH3 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
WDR44Q5JSH3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
WDR44Q5JSH3 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
WDR44Q5JSH3 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
WDR44Q5JSH3 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
WDR44Q5JSH3 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
WDR44Q5JSH3 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
WDR44Q5JSH3 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
WDR44Q5JSH3 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
WDR44Q5JSH3 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
WDR44Q5JSH3 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
WDR44Q5JSH3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
WDR44Q5JSH3 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
WDR44Q5JSH3 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
WDR44Q5JSH3 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
WDR44Q5JSH3 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
WDR44Q5JSH3 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
WDR44Q5JSH3 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
WDR44Q5JSH3 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
WDR44Q5JSH3 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
WDR44Q5JSH3 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
WDR44Q5JSH3 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
WDR44Q5JSH3 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
WDR44Q5JSH3 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
WDR44Q5JSH3 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
WDR44Q5JSH3 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
WDR44Q5JSH3 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
WDR44Q5JSH3 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
WDR44Q5JSH3 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
WDR44Q5JSH3 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
WDR44Q5JSH3 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
WDR44Q5JSH3 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
WDR44Q5JSH3 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
WDR44Q5JSH3 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
WDR44Q5JSH3 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
WDR44Q5JSH3 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
WDR44Q5JSH3 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
WDR44Q5JSH3 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
WDR44Q5JSH3 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
WDR44Q5JSH3 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms