Protein–RNA interactions for Protein: Q5JQC9

AKAP4, A-kinase anchor protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 854 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AKAP4Q5JQC9 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
AKAP4Q5JQC9 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
AKAP4Q5JQC9 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
AKAP4Q5JQC9 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC28.59■■■□□ 2.17
AKAP4Q5JQC9 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
AKAP4Q5JQC9 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
AKAP4Q5JQC9 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
AKAP4Q5JQC9 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
AKAP4Q5JQC9 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
AKAP4Q5JQC9 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
AKAP4Q5JQC9 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
AKAP4Q5JQC9 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
AKAP4Q5JQC9 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
AKAP4Q5JQC9 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
AKAP4Q5JQC9 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
AKAP4Q5JQC9 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
AKAP4Q5JQC9 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
AKAP4Q5JQC9 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
AKAP4Q5JQC9 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
AKAP4Q5JQC9 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
AKAP4Q5JQC9 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
AKAP4Q5JQC9 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
AKAP4Q5JQC9 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
AKAP4Q5JQC9 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
AKAP4Q5JQC9 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
AKAP4Q5JQC9 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
AKAP4Q5JQC9 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
AKAP4Q5JQC9 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
AKAP4Q5JQC9 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
AKAP4Q5JQC9 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
AKAP4Q5JQC9 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
AKAP4Q5JQC9 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
AKAP4Q5JQC9 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
AKAP4Q5JQC9 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
AKAP4Q5JQC9 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
AKAP4Q5JQC9 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
AKAP4Q5JQC9 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
AKAP4Q5JQC9 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
AKAP4Q5JQC9 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
AKAP4Q5JQC9 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
AKAP4Q5JQC9 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
AKAP4Q5JQC9 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
AKAP4Q5JQC9 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
AKAP4Q5JQC9 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
AKAP4Q5JQC9 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
AKAP4Q5JQC9 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
AKAP4Q5JQC9 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
AKAP4Q5JQC9 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
AKAP4Q5JQC9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
AKAP4Q5JQC9 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
AKAP4Q5JQC9 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
AKAP4Q5JQC9 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
AKAP4Q5JQC9 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
AKAP4Q5JQC9 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
AKAP4Q5JQC9 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
AKAP4Q5JQC9 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
AKAP4Q5JQC9 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
AKAP4Q5JQC9 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
AKAP4Q5JQC9 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
AKAP4Q5JQC9 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
AKAP4Q5JQC9 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
AKAP4Q5JQC9 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
AKAP4Q5JQC9 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
AKAP4Q5JQC9 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
AKAP4Q5JQC9 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC28.52■■■□□ 2.16
AKAP4Q5JQC9 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
AKAP4Q5JQC9 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
AKAP4Q5JQC9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
AKAP4Q5JQC9 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
AKAP4Q5JQC9 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
AKAP4Q5JQC9 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
AKAP4Q5JQC9 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
AKAP4Q5JQC9 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
AKAP4Q5JQC9 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
AKAP4Q5JQC9 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
AKAP4Q5JQC9 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
AKAP4Q5JQC9 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
AKAP4Q5JQC9 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
AKAP4Q5JQC9 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
AKAP4Q5JQC9 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
AKAP4Q5JQC9 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
AKAP4Q5JQC9 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
AKAP4Q5JQC9 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
AKAP4Q5JQC9 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
AKAP4Q5JQC9 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
AKAP4Q5JQC9 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
AKAP4Q5JQC9 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
AKAP4Q5JQC9 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
AKAP4Q5JQC9 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
AKAP4Q5JQC9 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
AKAP4Q5JQC9 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
AKAP4Q5JQC9 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
AKAP4Q5JQC9 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
AKAP4Q5JQC9 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
AKAP4Q5JQC9 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
AKAP4Q5JQC9 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
AKAP4Q5JQC9 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
AKAP4Q5JQC9 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
AKAP4Q5JQC9 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
AKAP4Q5JQC9 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms