Protein–RNA interactions for Protein: Q58EX2

SDK2, Protein sidekick-2, humanhuman

Predictions only

Length 2,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDK2Q58EX2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SDK2Q58EX2 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SDK2Q58EX2 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SDK2Q58EX2 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SDK2Q58EX2 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SDK2Q58EX2 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SDK2Q58EX2 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SDK2Q58EX2 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SDK2Q58EX2 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SDK2Q58EX2 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SDK2Q58EX2 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SDK2Q58EX2 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SDK2Q58EX2 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SDK2Q58EX2 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SDK2Q58EX2 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SDK2Q58EX2 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SDK2Q58EX2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SDK2Q58EX2 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SDK2Q58EX2 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SDK2Q58EX2 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SDK2Q58EX2 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SDK2Q58EX2 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SDK2Q58EX2 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SDK2Q58EX2 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SDK2Q58EX2 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SDK2Q58EX2 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SDK2Q58EX2 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SDK2Q58EX2 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SDK2Q58EX2 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SDK2Q58EX2 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SDK2Q58EX2 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SDK2Q58EX2 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SDK2Q58EX2 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SDK2Q58EX2 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SDK2Q58EX2 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SDK2Q58EX2 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SDK2Q58EX2 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SDK2Q58EX2 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SDK2Q58EX2 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SDK2Q58EX2 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SDK2Q58EX2 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SDK2Q58EX2 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SDK2Q58EX2 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SDK2Q58EX2 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SDK2Q58EX2 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SDK2Q58EX2 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SDK2Q58EX2 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SDK2Q58EX2 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SDK2Q58EX2 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SDK2Q58EX2 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SDK2Q58EX2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SDK2Q58EX2 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SDK2Q58EX2 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SDK2Q58EX2 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SDK2Q58EX2 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SDK2Q58EX2 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SDK2Q58EX2 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SDK2Q58EX2 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SDK2Q58EX2 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SDK2Q58EX2 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SDK2Q58EX2 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SDK2Q58EX2 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SDK2Q58EX2 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SDK2Q58EX2 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SDK2Q58EX2 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SDK2Q58EX2 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SDK2Q58EX2 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SDK2Q58EX2 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SDK2Q58EX2 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SDK2Q58EX2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SDK2Q58EX2 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SDK2Q58EX2 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SDK2Q58EX2 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SDK2Q58EX2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SDK2Q58EX2 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SDK2Q58EX2 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SDK2Q58EX2 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SDK2Q58EX2 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SDK2Q58EX2 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SDK2Q58EX2 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SDK2Q58EX2 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SDK2Q58EX2 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SDK2Q58EX2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SDK2Q58EX2 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SDK2Q58EX2 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SDK2Q58EX2 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SDK2Q58EX2 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SDK2Q58EX2 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SDK2Q58EX2 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SDK2Q58EX2 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SDK2Q58EX2 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SDK2Q58EX2 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SDK2Q58EX2 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SDK2Q58EX2 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SDK2Q58EX2 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SDK2Q58EX2 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SDK2Q58EX2 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SDK2Q58EX2 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SDK2Q58EX2 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SDK2Q58EX2 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms